51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2563 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2563  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  264  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0960828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2750  hypothetical protein  92.42 
 
 		 132 aa  246  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200104  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2746  hypothetical protein  78.03 
 
 		 132 aa  211  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000088314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2454  hypothetical protein  66.67 
 
 		 132 aa  186  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0316  hypothetical protein  68.94 
 
 		 135 aa  179  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0768  hypothetical protein  65.89 
 
 		 132 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1177  hypothetical protein  62.88 
 
 		 132 aa  176  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1680  hypothetical protein  67.44 
 
 		 123 aa  169  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1677  hypothetical protein  60.94 
 
 		 132 aa  167  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2315  hypothetical protein  62.88 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.427375  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4784  hypothetical protein  62.88 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4663  hypothetical protein  58.33 
 
 		 134 aa  150  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255213  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1077  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  55.81 
 
 		 126 aa  141  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0643  hypothetical protein  53.12 
 
 		 132 aa  126  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0796  hypothetical protein  49.24 
 
 		 131 aa  120  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0540  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  40.91 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45638  predicted protein  39.23 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2576  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  35.61 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1233  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  31.06 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.622337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1237  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  31.06 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0224314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3513  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  31.06 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.133663  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1786  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  29.01 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0003  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  31.33 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.702249  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1237  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  33.33 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0590  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  29.46 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2000  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  30.83 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.155621  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1351  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  25.74 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1493  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  30.53 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222013  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4642  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  26.56 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1716  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  31 
 
 		 129 aa  48.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307308  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0097  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  35.53 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0129  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  28.68 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249671 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1643  6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase  28.12 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1845  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  25.71 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.889978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3631  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  22.66 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.867896  normal  0.305181 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0414  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  29.91 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2121  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  26.72 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.576157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1986  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  32.5 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1485  queuosine biosynthesis protein QueD  30.43 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.959398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1657  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  24.43 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108089  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1395  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  33.8 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.728464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2197  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  30.23 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1389  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  26.67 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1605  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  27.84 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.68455  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1354  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  32.35 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2966  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  26.72 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1317  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  25.95 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0808696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1720  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase family protein  24.43 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0388786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0432  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  29.82 
 
 		 294 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0347  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  32.98 
 
 		 306 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2756  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  33.67 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>