48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0540 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0540  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  100 
 
 		 128 aa  264  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1077  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  48.41 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1177  hypothetical protein  44.96 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2315  hypothetical protein  42.64 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.427375  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4663  hypothetical protein  43.18 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255213  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4784  hypothetical protein  38.24 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0768  hypothetical protein  43.41 
 
 		 132 aa  106  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2454  hypothetical protein  42.42 
 
 		 132 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2746  hypothetical protein  40.91 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000088314  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1677  hypothetical protein  40.15 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2563  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0960828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2750  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200104  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1680  hypothetical protein  36.59 
 
 		 123 aa  93.6  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31013  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0316  hypothetical protein  36.92 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0643  hypothetical protein  37.6 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0796  hypothetical protein  35.2 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2576  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  32.8 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45638  predicted protein  36.84 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3631  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  26.45 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.867896  normal  0.305181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1237  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  25 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0224314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1233  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  25 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.622337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1657  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  29.03 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108089  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1354  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  28.09 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0003  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  25.64 
 
 		 127 aa  50.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.702249  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1237  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  30.23 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1493  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  23.97 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222013  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0414  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  27.64 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1986  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  28.43 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1643  6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase  26.83 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113044  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1720  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase family protein  26.61 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0388786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1339  queuosine biosynthesis protein QueD  26.8 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293093  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1437  queuosine biosynthesis protein QueD  26.8 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2966  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  26.45 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1317  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  27.27 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0808696  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2626  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  27.45 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000218474  normal  0.385805 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0590  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  26.02 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1754  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  27.5 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1786  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  23.97 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2121  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  24.79 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.576157  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0097  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  23.08 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4642  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  20.97 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1395  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  24.37 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.728464 
 
 
-
 
NC_002936  DET1605  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  22.95 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.68455  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2514  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  28.57 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0457713  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0527  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  27.78 
 
 		 129 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.291388  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2197  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  24.59 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0831  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  23.33 
 
 		 126 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.259077  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1487  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase-like protein  22.13 
 
 		 123 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>