41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2315 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2315  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.427375  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4663  hypothetical protein  74.24 
 
 
134 aa  201  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255213  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4784  hypothetical protein  72.18 
 
 
134 aa  189  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2454  hypothetical protein  59.09 
 
 
132 aa  164  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2750  hypothetical protein  59.85 
 
 
132 aa  159  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200104  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1177  hypothetical protein  56.06 
 
 
132 aa  153  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0768  hypothetical protein  58.14 
 
 
132 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2746  hypothetical protein  59.69 
 
 
132 aa  150  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000088314  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2563  hypothetical protein  62.88 
 
 
132 aa  147  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0960828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1677  hypothetical protein  52.27 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0316  hypothetical protein  54.55 
 
 
135 aa  140  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1680  hypothetical protein  54.47 
 
 
123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31013  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1077  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  47.69 
 
 
126 aa  121  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0540  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  42.64 
 
 
128 aa  115  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0643  hypothetical protein  47.76 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0796  hypothetical protein  49.25 
 
 
131 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45638  predicted protein  37.4 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2576  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  36.63 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0003  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  28.87 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.702249  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1233  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  28.26 
 
 
130 aa  50.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.622337  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1237  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  27.54 
 
 
130 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0224314  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1754  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  26.12 
 
 
128 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0097  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  34.67 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1986  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  30.21 
 
 
126 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1786  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  28.87 
 
 
122 aa  48.5  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2197  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  34.62 
 
 
130 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1643  6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase  29.59 
 
 
122 aa  48.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1354  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  29.17 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0980317  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1485  queuosine biosynthesis protein QueD  30.77 
 
 
135 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.959398  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0129  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  27.84 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249671 
 
 
-
 
NC_002936  DET1605  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  28.42 
 
 
123 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.68455  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3513  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  25.76 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.133663  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2514  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  28.16 
 
 
138 aa  43.9  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0457713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1237  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  30.61 
 
 
126 aa  43.9  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1493  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  25 
 
 
129 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222013  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1437  queuosine biosynthesis protein QueD  27.18 
 
 
130 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1339  queuosine biosynthesis protein QueD  27.18 
 
 
130 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293093  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1395  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  29.49 
 
 
130 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.728464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1657  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  25 
 
 
122 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108089  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4642  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  24.24 
 
 
125 aa  41.6  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1389  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  25 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>