43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0316 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0316  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2750  hypothetical protein  68.94 
 
 		 132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200104  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2746  hypothetical protein  68.94 
 
 		 132 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000088314  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2563  hypothetical protein  68.94 
 
 		 132 aa  168  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0960828 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2454  hypothetical protein  61.36 
 
 		 132 aa  167  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1177  hypothetical protein  57.58 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1677  hypothetical protein  56.25 
 
 		 132 aa  153  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1680  hypothetical protein  62.02 
 
 		 123 aa  152  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31013  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4784  hypothetical protein  61.19 
 
 		 134 aa  148  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0768  hypothetical protein  56.59 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2315  hypothetical protein  54.55 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.427375  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1077  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  54.26 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4663  hypothetical protein  55.22 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255213  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0643  hypothetical protein  50.78 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0796  hypothetical protein  47.73 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0540  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  36.92 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45638  predicted protein  40.46 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2576  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  36.36 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1233  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  35.61 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.622337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1237  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  34.85 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0224314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0129  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  33.05 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249671 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1716  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  37.11 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307308  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2000  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  31.85 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.155621  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1485  queuosine biosynthesis protein QueD  32.31 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.959398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1786  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  27.34 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1237  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  34.88 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2197  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  31.01 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1493  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  32.63 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222013  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3513  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  29.41 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.133663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3631  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  25 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.867896  normal  0.305181 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1395  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  35.21 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.728464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0097  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  31.4 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0003  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  31.09 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.702249  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0590  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  29 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1986  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  29.46 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1487  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase-like protein  30.93 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1351  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  25.24 
 
 		 123 aa  42.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1953  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase  27.61 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1389  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  26.97 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2626  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  29.17 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000218474  normal  0.385805 
 
 
-
 
NC_002936  DET1605  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  27.08 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.68455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1643  6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase  26.04 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4642  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  26.56 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>