53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1077 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1077  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  100 
 
 		 126 aa  259  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2454  hypothetical protein  55.3 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2746  hypothetical protein  55.81 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000088314  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0768  hypothetical protein  55.38 
 
 		 132 aa  146  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2563  hypothetical protein  55.04 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0960828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0316  hypothetical protein  54.26 
 
 		 135 aa  137  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2750  hypothetical protein  53.49 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200104  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1177  hypothetical protein  50.76 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4784  hypothetical protein  48.15 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4663  hypothetical protein  49.62 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0540  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  48.41 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2315  hypothetical protein  47.69 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.427375  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1677  hypothetical protein  46.88 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0643  hypothetical protein  50.4 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1680  hypothetical protein  50.41 
 
 		 123 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31013  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0796  hypothetical protein  45.6 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45638  predicted protein  44.19 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2576  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  37.6 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1233  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  33.06 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.622337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1237  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  33.06 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0224314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0590  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  34.15 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3631  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  27.27 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.867896  normal  0.305181 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1643  6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase  29.84 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1657  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  30 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108089  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1493  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  28.93 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1754  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  32 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1487  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase-like protein  33.68 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1395  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  33.67 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.728464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1986  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  28.1 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1845  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  28.93 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.889978  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1351  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  33.68 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1720  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase family protein  27.27 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0388786  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0129  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  31 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249671 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1716  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  32 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307308  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2966  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  28.69 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201873 
 
 
-
 
NC_002936  DET1605  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  31.58 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.68455  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2121  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  29.92 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.576157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1317  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  28.1 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0808696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1786  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  24.79 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1389  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  27.96 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13633  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  31.11 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4642  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  22.58 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2626  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  30.21 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000218474  normal  0.385805 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0831  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  26.67 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.259077  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1680  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  28.69 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0989976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0003  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  25.51 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.702249  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0704  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  27.34 
 
 		 275 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.926222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1485  queuosine biosynthesis protein QueD  30.43 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.959398  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1339  queuosine biosynthesis protein QueD  24.72 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293093  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1437  queuosine biosynthesis protein QueD  24.72 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2514  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  25 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0457713  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0300  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  27.34 
 
 		 280 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000447868  normal  0.0102955 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3513  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  23.58 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.133663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>