40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4784 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4784  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  265  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4663  hypothetical protein  87.31 
 
 		 134 aa  237  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2315  hypothetical protein  72.18 
 
 		 159 aa  199  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.427375  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2454  hypothetical protein  61.36 
 
 		 132 aa  170  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2750  hypothetical protein  62.88 
 
 		 132 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200104  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0768  hypothetical protein  63.08 
 
 		 132 aa  160  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1177  hypothetical protein  58.33 
 
 		 132 aa  157  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0316  hypothetical protein  61.19 
 
 		 135 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2746  hypothetical protein  62.12 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000088314  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1677  hypothetical protein  54.69 
 
 		 132 aa  150  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2563  hypothetical protein  62.88 
 
 		 132 aa  143  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0960828 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1077  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  51.88 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1680  hypothetical protein  56.59 
 
 		 123 aa  133  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31013  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0540  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  41.04 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0643  hypothetical protein  52.34 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0796  hypothetical protein  47.73 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45638  predicted protein  42.11 
 
 		 157 aa  86.7  9e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2576  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  36.36 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1237  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  34.34 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0224314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1233  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  34.34 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.622337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0097  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  30.61 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2197  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  30.23 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1986  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  29.7 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1754  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  27.19 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0003  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  26.04 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.702249  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1389  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  27.17 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0590  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  30.61 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3513  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  31.06 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.133663  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2626  6-pyruvoyltetrahydropterin synthase  25.71 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000218474  normal  0.385805 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1716  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  29.9 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307308  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0129  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  26.8 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249671 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1643  6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase  26.92 
 
 		 122 aa  42.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113044  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1487  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase-like protein  26.26 
 
 		 123 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1786  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  28.41 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3494  queuosine biosynthesis protein QueD  36.36 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1237  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  29.46 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2038  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  28.77 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3789  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1351  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  24.75 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1605  6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, putative  25.25 
 
 		 123 aa  40  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.68455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>