More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1023 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1023  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
632 aa  1267    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  37.35 
 
 
2156 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  37.2 
 
 
2156 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  37.35 
 
 
2156 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  40.2 
 
 
5654 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  40.85 
 
 
6661 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  39.09 
 
 
5953 aa  372  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  39.11 
 
 
13537 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  37.77 
 
 
1146 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  37.46 
 
 
5469 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  39.72 
 
 
8914 aa  362  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  38.55 
 
 
8646 aa  362  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  40.07 
 
 
8915 aa  362  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  37.83 
 
 
5372 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  37.54 
 
 
1114 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  38.95 
 
 
6676 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  38.91 
 
 
1990 aa  356  5.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  37.97 
 
 
1776 aa  356  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  40.31 
 
 
6889 aa  355  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  35.58 
 
 
3308 aa  352  8e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  37.26 
 
 
2033 aa  352  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  35.97 
 
 
1345 aa  351  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  38.69 
 
 
5213 aa  349  9e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  36.85 
 
 
2666 aa  349  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  39.66 
 
 
1449 aa  349  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  39.32 
 
 
4531 aa  347  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  41.56 
 
 
1839 aa  347  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  34.94 
 
 
1556 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  37.22 
 
 
2154 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  36.59 
 
 
2625 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  35.73 
 
 
1142 aa  342  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  31.95 
 
 
3235 aa  341  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  37.87 
 
 
3650 aa  341  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  37.12 
 
 
3432 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  34.94 
 
 
1556 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  38.97 
 
 
6176 aa  341  2.9999999999999998e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  41.61 
 
 
7310 aa  340  5.9999999999999996e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  37.58 
 
 
1383 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  40.03 
 
 
1769 aa  339  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  40.2 
 
 
4991 aa  339  8e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  34.65 
 
 
4968 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  38.91 
 
 
1405 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  36.22 
 
 
5596 aa  338  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  38 
 
 
3942 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  35.96 
 
 
2581 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  39.61 
 
 
2439 aa  337  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  37.39 
 
 
2151 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  36.79 
 
 
1518 aa  336  7e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  36.63 
 
 
1518 aa  336  7e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  36.95 
 
 
2573 aa  336  9e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  37.54 
 
 
4747 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  40.33 
 
 
5698 aa  334  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  39.14 
 
 
2626 aa  334  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  37.97 
 
 
2561 aa  334  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  35.17 
 
 
2164 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  35.7 
 
 
1518 aa  333  5e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  35.17 
 
 
4960 aa  333  6e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  33.16 
 
 
888 aa  333  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  38.29 
 
 
5422 aa  333  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1791  non-ribosomal peptide synthase  39.53 
 
 
1082 aa  333  8e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1704  non-ribosomal peptide synthase  39.53 
 
 
1082 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  34.67 
 
 
3291 aa  332  9e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  36.06 
 
 
2386 aa  332  9e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  37.99 
 
 
3331 aa  332  9e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  34.62 
 
 
4960 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0269  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.53 
 
 
1082 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  38.99 
 
 
1110 aa  331  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  37.97 
 
 
4037 aa  331  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  37.99 
 
 
1334 aa  332  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  33.72 
 
 
1870 aa  331  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  38.1 
 
 
1137 aa  331  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0118  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.36 
 
 
1071 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  33.72 
 
 
1870 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1117  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.36 
 
 
1082 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1287  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.36 
 
 
1082 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0308  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.36 
 
 
1082 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  37.85 
 
 
2878 aa  329  8e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  32.61 
 
 
1336 aa  329  8e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  37.85 
 
 
5230 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  35.77 
 
 
3639 aa  329  8e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  37.35 
 
 
1689 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  36.41 
 
 
2386 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1749  amino acid adenylation domain protein  38.07 
 
 
1199 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.82306  normal  0.0351239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  38.82 
 
 
1779 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.06 
 
 
2385 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  36.88 
 
 
9498 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  37.59 
 
 
1129 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.06 
 
 
2385 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  39.65 
 
 
7712 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  35.98 
 
 
2875 aa  328  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  37.31 
 
 
5929 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  38.87 
 
 
6072 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  36.29 
 
 
4502 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  37.9 
 
 
4383 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  36.17 
 
 
1578 aa  328  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  34.78 
 
 
1550 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  39.04 
 
 
3352 aa  327  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  36.84 
 
 
2596 aa  327  5e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  39.04 
 
 
3328 aa  327  6e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  35.27 
 
 
3498 aa  327  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>