63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4302 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4302  Prolyl-tRNA synthetase-like protein  100 
 
 		 474 aa  951    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1635  prolyl-tRNA synthetase  21.21 
 
 		 481 aa  103  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0728  prolyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 		 465 aa  99  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.102661  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1921  prolyl-tRNA synthetase  23.89 
 
 		 480 aa  97.8  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1972  prolyl-tRNA synthetase  26.3 
 
 		 481 aa  97.4  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1963  prolyl-tRNA synthetase  22.69 
 
 		 478 aa  97.1  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.914598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0179  prolyl-tRNA synthetase  22.9 
 
 		 480 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1139  prolyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 		 478 aa  94.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1386  prolyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 		 477 aa  93.6  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.399979  normal  0.968589 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1092  prolyl-tRNA synthetase  25.26 
 
 		 487 aa  93.2  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0822  prolyl-tRNA synthetase  25.17 
 
 		 488 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.62191  normal  0.0638308 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0803  prolyl-tRNA synthetase  25.67 
 
 		 488 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0190  prolyl-tRNA synthetase  21.85 
 
 		 478 aa  89.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.15585  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1366  prolyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 487 aa  89  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0234  prolyl-tRNA synthetase  22.95 
 
 		 456 aa  89  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2042  prolyl-tRNA synthetase  24.56 
 
 		 477 aa  86.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1640  prolyl-tRNA synthetase  23.97 
 
 		 478 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1574  prolyl-tRNA synthetase  24.21 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1723  prolyl-tRNA synthetase  24.21 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.612812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0945  prolyl-tRNA synthetase  24.72 
 
 		 479 aa  80.1  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258723  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0880  prolyl-tRNA synthetase  24.13 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0188  prolyl-tRNA synthetase  24.13 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0817  prolyl-tRNA synthetase  23.83 
 
 		 482 aa  70.9  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0570  prolyl-tRNA synthetase  24.6 
 
 		 497 aa  70.1  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.267387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1192  prolyl-tRNA synthetase  25.59 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2180  prolyl-tRNA synthetase  24.64 
 
 		 468 aa  67  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1303  prolyl-tRNA synthetase  24.71 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0348  prolyl-tRNA synthetase  24.6 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4267  prolyl-tRNA synthetase  24.78 
 
 		 468 aa  57  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.975115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3132  prolyl-tRNA synthetase  20.72 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.778775  normal  0.421139 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0830  prolyl-tRNA synthetase  21.36 
 
 		 480 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1087  prolyl-tRNA synthetase  22.26 
 
 		 476 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.723439  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3199  prolyl-tRNA synthetase  21.05 
 
 		 493 aa  54.7  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43097  predicted protein  20.78 
 
 		 671 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0405  prolyl-tRNA synthetase  20.58 
 
 		 488 aa  54.3  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8092  prolyl-tRNA synthetase  21.65 
 
 		 480 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2528  prolyl-tRNA synthetase  20.27 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0089  prolyl-tRNA synthetase  20.58 
 
 		 477 aa  50.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0777  prolyl-tRNA synthetase  19.39 
 
 		 491 aa  50.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0370  prolyl-tRNA synthetase  19.24 
 
 		 476 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0313  prolyl-tRNA synthetase  21.07 
 
 		 478 aa  49.3  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000674041  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0435  prolyl-tRNA synthetase  20.28 
 
 		 483 aa  49.3  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2695  prolyl-tRNA synthetase  20.39 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000655749  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1230  prolyl-tRNA synthetase  21.03 
 
 		 527 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0510  prolyl-tRNA synthetase  18.48 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1665  prolyl-tRNA synthetase  20.91 
 
 		 483 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0373  prolyl-tRNA synthetase  19.24 
 
 		 476 aa  48.5  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0382  prolyl-tRNA synthetase  17.89 
 
 		 476 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0658  prolyl-tRNA synthetase  19.93 
 
 		 480 aa  48.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0440  prolyl-tRNA synthetase  18.95 
 
 		 476 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0461  prolyl-tRNA synthetase  19.53 
 
 		 476 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4863  prolyl-tRNA synthetase  19.24 
 
 		 476 aa  47  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4939  prolyl-tRNA synthetase  19.54 
 
 		 492 aa  47  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.580893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0396  prolyl-tRNA synthetase  19.24 
 
 		 508 aa  46.6  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.468915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0382  prolyl-tRNA synthetase  19.24 
 
 		 508 aa  46.6  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0469  prolyl-tRNA synthetase  20.58 
 
 		 477 aa  46.6  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0345  prolyl-tRNA synthetase  19.8 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139585  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0217  prolyl-tRNA synthetase  17.98 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000503447  normal  0.017665 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0510  prolyl-tRNA synthetase  18.95 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0376  prolyl-tRNA synthetase  17.73 
 
 		 476 aa  44.3  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02150  prolyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G16010)  21.58 
 
 		 594 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05640  proline-tRNA ligase, putative  23.02 
 
 		 740 aa  43.9  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2310  prolyl-tRNA synthetase  20.27 
 
 		 490 aa  43.5  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>