38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3707 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3707  hypothetical protein  100 
 
 		 573 aa  1142    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.632256  normal  0.317284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0509  TrkA-N domain protein  38.18 
 
 		 607 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466068  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0187  TrkA domain-containing protein  33.12 
 
 		 653 aa  256  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.390007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0415  TrkA-like  37.17 
 
 		 499 aa  210  6e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0668  hypothetical protein  35.67 
 
 		 838 aa  100  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1166  hypothetical protein  37.5 
 
 		 211 aa  90.9  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0168767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08520  hypothetical protein  33.94 
 
 		 509 aa  85.1  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.865531  normal  0.0343131 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1462  hypothetical protein  31.48 
 
 		 917 aa  80.5  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0414  putative ryanodine receptor  44.79 
 
 		 101 aa  80.5  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.425505  normal  0.313616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3336  TrkA domain-containing protein  31.68 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4290  TrkA domain-containing protein  33.82 
 
 		 606 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  decreased coverage  0.00534263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0931  TrkA domain-containing protein  35.04 
 
 		 605 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18233  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2769  TrkA-N domain protein  32.58 
 
 		 565 aa  53.5  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  21 
 
 		 341 aa  53.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  29.58 
 
 		 346 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  31.52 
 
 		 347 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  29.41 
 
 		 335 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4293  hypothetical protein  29.17 
 
 		 789 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  34.88 
 
 		 371 aa  49.3  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  32.14 
 
 		 251 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  29.41 
 
 		 335 aa  48.5  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  32.22 
 
 		 346 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4032  TrkA-N  29.55 
 
 		 565 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.341469 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  35.48 
 
 		 350 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  36.36 
 
 		 252 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  26.9 
 
 		 450 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  23.81 
 
 		 417 aa  45.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3306  TrkA-N domain protein  32.89 
 
 		 568 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.484589 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  25.58 
 
 		 333 aa  44.3  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2794  TrkA-N domain protein  32.89 
 
 		 568 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  30.11 
 
 		 350 aa  43.9  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  23.81 
 
 		 417 aa  43.5  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  23.81 
 
 		 417 aa  43.5  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  23.81 
 
 		 417 aa  43.5  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  23.81 
 
 		 417 aa  43.5  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  23.81 
 
 		 417 aa  43.5  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  23.81 
 
 		 402 aa  43.5  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  23.81 
 
 		 417 aa  43.5  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>