34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0187 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0187  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 653 aa  1288    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.390007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3707  hypothetical protein  33.12 
 
 		 573 aa  249  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.632256  normal  0.317284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0509  TrkA-N domain protein  32.24 
 
 		 607 aa  236  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466068  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1166  hypothetical protein  50.94 
 
 		 211 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0168767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0415  TrkA-like  27.2 
 
 		 499 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0668  hypothetical protein  35.48 
 
 		 838 aa  70.9  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0414  putative ryanodine receptor  43.84 
 
 		 101 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.425505  normal  0.313616 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08520  hypothetical protein  30.49 
 
 		 509 aa  63.5  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.865531  normal  0.0343131 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1462  hypothetical protein  25 
 
 		 917 aa  60.1  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  27.83 
 
 		 330 aa  55.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2853  TrkA-N  24 
 
 		 561 aa  55.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  26.8 
 
 		 335 aa  54.3  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  26.18 
 
 		 335 aa  54.3  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  26.18 
 
 		 335 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  35.48 
 
 		 384 aa  51.6  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  28.21 
 
 		 330 aa  50.4  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  23.9 
 
 		 339 aa  50.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2939  TrkA-N  26.32 
 
 		 749 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0931  TrkA domain-containing protein  34.83 
 
 		 605 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18233  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4293  hypothetical protein  31.45 
 
 		 789 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  36.36 
 
 		 256 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  25 
 
 		 330 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  30.56 
 
 		 335 aa  46.6  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  33.66 
 
 		 252 aa  47.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  21.58 
 
 		 341 aa  46.2  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  27.18 
 
 		 347 aa  45.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  33.33 
 
 		 330 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  28.43 
 
 		 325 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  33.33 
 
 		 334 aa  45.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  33.33 
 
 		 330 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  33.33 
 
 		 334 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  31.4 
 
 		 366 aa  44.3  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  28.79 
 
 		 658 aa  43.9  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  26.96 
 
 		 371 aa  43.9  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>