12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0415 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0415  TrkA-like  100 
 
 		 499 aa  1002    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3707  hypothetical protein  37.17 
 
 		 573 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.632256  normal  0.317284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0187  TrkA domain-containing protein  27.2 
 
 		 653 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.390007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0509  TrkA-N domain protein  29.61 
 
 		 607 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466068  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4215  TrkA-N domain protein  26.55 
 
 		 428 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0242  TrkA domain-containing protein  37.84 
 
 		 668 aa  47.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4290  TrkA domain-containing protein  28.07 
 
 		 606 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  decreased coverage  0.00534263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0931  TrkA domain-containing protein  27.97 
 
 		 605 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18233  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  30.28 
 
 		 345 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  31.25 
 
 		 371 aa  46.2  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  31.91 
 
 		 366 aa  43.5  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2769  TrkA-N domain protein  32.14 
 
 		 565 aa  43.5  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>