17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4215 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4215  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 428 aa  860    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  28.04 
 
 		 351 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  26.98 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  26.98 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  26.98 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0509  TrkA-N domain protein  25.67 
 
 		 607 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466068  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2548  potassium efflux system protein  27.42 
 
 		 662 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1392  putative TrkA family protein  29.11 
 
 		 641 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  28.71 
 
 		 355 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0406  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.27 
 
 		 638 aa  45.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0122767  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001379  glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC  28.8 
 
 		 652 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000096581  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05273  hypothetical protein  25.75 
 
 		 652 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  40 
 
 		 299 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1733  potassium efflux system protein  30.64 
 
 		 590 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  39.51 
 
 		 253 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3105  TrkA-N  26.83 
 
 		 683 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.716552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0283  TrkA domain-containing protein  30.97 
 
 		 639 aa  43.1  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244298  normal  0.293547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>