24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0669 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0527  hypothetical protein  78.33 
 
 
406 aa  672    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3729  hypothetical protein  97.78 
 
 
406 aa  811    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0669  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  828    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3116  hypothetical protein  76.35 
 
 
406 aa  653    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000795792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0596  hypothetical protein  97.78 
 
 
406 aa  811    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3883  hypothetical protein  78.82 
 
 
406 aa  674    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.870607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0718  hypothetical protein  78.33 
 
 
406 aa  663    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0594  hypothetical protein  76.11 
 
 
406 aa  653    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.554902  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0640  hypothetical protein  93.6 
 
 
406 aa  787    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3380  hypothetical protein  95.07 
 
 
406 aa  796    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000367008 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0640  hypothetical protein  94.09 
 
 
406 aa  790    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3855  hypothetical protein  98.03 
 
 
406 aa  813    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205648 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2989  hypothetical protein  79.31 
 
 
406 aa  676    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3782  hypothetical protein  80.05 
 
 
406 aa  676    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00295666  hitchhiker  0.00018284 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3672  hypothetical protein  97.54 
 
 
406 aa  808    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.544261 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4006  hypothetical protein  95.32 
 
 
407 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39050  hypothetical protein  63.79 
 
 
406 aa  541  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01696  hypothetical protein  50.99 
 
 
405 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2243  hypothetical protein  34.07 
 
 
424 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1848  hypothetical protein  21.27 
 
 
413 aa  90.9  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.688083  normal  0.266524 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4084  hypothetical protein  23.57 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.460478  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2618  hypothetical protein  22.81 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103688  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4478  hypothetical protein  24.52 
 
 
413 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4988  hypothetical protein  21.84 
 
 
407 aa  42.7  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>