22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01696 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01696  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  835    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0640  hypothetical protein  52.22 
 
 
406 aa  428  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4006  hypothetical protein  51.97 
 
 
407 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3380  hypothetical protein  51.97 
 
 
406 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000367008 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0640  hypothetical protein  51.72 
 
 
406 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0596  hypothetical protein  50.86 
 
 
406 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0669  hypothetical protein  50.99 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3729  hypothetical protein  50.86 
 
 
406 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3855  hypothetical protein  50.61 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205648 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3672  hypothetical protein  50.61 
 
 
406 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.544261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0527  hypothetical protein  50.12 
 
 
406 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3883  hypothetical protein  50.74 
 
 
406 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.870607 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3782  hypothetical protein  50.49 
 
 
406 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00295666  hitchhiker  0.00018284 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2989  hypothetical protein  50.98 
 
 
406 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0594  hypothetical protein  49.27 
 
 
406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.554902  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39050  hypothetical protein  51.11 
 
 
406 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121024  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0718  hypothetical protein  48.4 
 
 
406 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3116  hypothetical protein  48.77 
 
 
406 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000795792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2243  hypothetical protein  34.16 
 
 
424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4084  hypothetical protein  23.94 
 
 
418 aa  86.7  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.460478  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2618  hypothetical protein  21.01 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103688  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1848  hypothetical protein  19.71 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.688083  normal  0.266524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>