22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3883 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4006  hypothetical protein  78.57 
 
 		 407 aa  671    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3672  hypothetical protein  78.82 
 
 		 406 aa  669    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.544261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3782  hypothetical protein  91.63 
 
 		 406 aa  765    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00295666  hitchhiker  0.00018284 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3855  hypothetical protein  79.06 
 
 		 406 aa  672    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205648 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0718  hypothetical protein  86.7 
 
 		 406 aa  724    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3883  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  828    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.870607 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3729  hypothetical protein  79.06 
 
 		 406 aa  671    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0669  hypothetical protein  78.82 
 
 		 406 aa  674    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3116  hypothetical protein  82.76 
 
 		 406 aa  689    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0596  hypothetical protein  79.06 
 
 		 406 aa  671    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0640  hypothetical protein  78.57 
 
 		 406 aa  669    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0527  hypothetical protein  76.35 
 
 		 406 aa  652    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3380  hypothetical protein  79.06 
 
 		 406 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000367008 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0640  hypothetical protein  78.33 
 
 		 406 aa  668    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134735 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2989  hypothetical protein  78.08 
 
 		 406 aa  658    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0594  hypothetical protein  73.15 
 
 		 406 aa  627  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.554902  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39050  hypothetical protein  62.32 
 
 		 406 aa  521  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01696  hypothetical protein  50.74 
 
 		 405 aa  413  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2243  hypothetical protein  35.06 
 
 		 424 aa  230  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4084  hypothetical protein  25.19 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.460478  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1848  hypothetical protein  21.46 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.688083  normal  0.266524 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2618  hypothetical protein  21.46 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>