23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2618 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2618  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  870    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103688  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1848  hypothetical protein  66.43 
 
 		 413 aa  587  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.688083  normal  0.266524 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0594  hypothetical protein  23.9 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.554902  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0527  hypothetical protein  24.03 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0718  hypothetical protein  22.66 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01696  hypothetical protein  21.01 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3380  hypothetical protein  22.46 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000367008 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4006  hypothetical protein  21.93 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2989  hypothetical protein  23.88 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3672  hypothetical protein  21.66 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.544261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0596  hypothetical protein  21.66 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3729  hypothetical protein  21.66 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0669  hypothetical protein  22.81 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3782  hypothetical protein  20.9 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00295666  hitchhiker  0.00018284 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0640  hypothetical protein  21.93 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0640  hypothetical protein  21.66 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3855  hypothetical protein  21.39 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3883  hypothetical protein  21.46 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.870607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39050  hypothetical protein  21.35 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121024  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3116  hypothetical protein  21.31 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2243  hypothetical protein  20.63 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4478  hypothetical protein  21.66 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4988  hypothetical protein  19.15 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>