15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4478 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4478  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  838    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4988  hypothetical protein  61.75 
 
 		 407 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100842 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3116  hypothetical protein  24.89 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795792 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0640  hypothetical protein  22.18 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0640  hypothetical protein  22.18 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3672  hypothetical protein  22.3 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.544261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0596  hypothetical protein  22.3 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2618  hypothetical protein  20.88 
 
 		 421 aa  46.6  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103688  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3729  hypothetical protein  22.3 
 
 		 406 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4006  hypothetical protein  21.79 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0669  hypothetical protein  21.93 
 
 		 406 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3855  hypothetical protein  21.93 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205648 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3380  hypothetical protein  21.79 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000367008 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2989  hypothetical protein  22.46 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0527  hypothetical protein  23.58 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>