24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3116 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0527  hypothetical protein  75.62 
 
 		 406 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3729  hypothetical protein  76.35 
 
 		 406 aa  647    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0669  hypothetical protein  76.35 
 
 		 406 aa  653    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3116  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  830    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0596  hypothetical protein  76.35 
 
 		 406 aa  647    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3883  hypothetical protein  82.76 
 
 		 406 aa  689    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.870607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0718  hypothetical protein  80.79 
 
 		 406 aa  663    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0640  hypothetical protein  77.34 
 
 		 406 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3380  hypothetical protein  77.09 
 
 		 406 aa  654    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000367008 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0640  hypothetical protein  76.85 
 
 		 406 aa  651    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3855  hypothetical protein  76.35 
 
 		 406 aa  648    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205648 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2989  hypothetical protein  77.26 
 
 		 406 aa  650    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3782  hypothetical protein  83 
 
 		 406 aa  690    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00295666  hitchhiker  0.00018284 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3672  hypothetical protein  76.11 
 
 		 406 aa  645    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.544261 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4006  hypothetical protein  76.6 
 
 		 407 aa  652    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0594  hypothetical protein  74.63 
 
 		 406 aa  622  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.554902  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39050  hypothetical protein  63.55 
 
 		 406 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01696  hypothetical protein  48.77 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2243  hypothetical protein  35.94 
 
 		 424 aa  236  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4084  hypothetical protein  25.74 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.460478  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1848  hypothetical protein  21.76 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.688083  normal  0.266524 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2618  hypothetical protein  21.31 
 
 		 421 aa  67  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103688  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4478  hypothetical protein  27.74 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4988  hypothetical protein  23.35 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>