22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3782 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4006  hypothetical protein  79.8 
 
 		 407 aa  674    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3672  hypothetical protein  79.56 
 
 		 406 aa  667    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.544261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3782  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  830    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00295666  hitchhiker  0.00018284 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3855  hypothetical protein  79.8 
 
 		 406 aa  669    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205648 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0718  hypothetical protein  85.71 
 
 		 406 aa  716    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3883  hypothetical protein  91.63 
 
 		 406 aa  765    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.870607 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3729  hypothetical protein  79.8 
 
 		 406 aa  669    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0669  hypothetical protein  80.05 
 
 		 406 aa  676    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3116  hypothetical protein  83 
 
 		 406 aa  690    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0596  hypothetical protein  79.8 
 
 		 406 aa  669    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0640  hypothetical protein  79.31 
 
 		 406 aa  669    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0527  hypothetical protein  75.62 
 
 		 406 aa  644    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3380  hypothetical protein  80.3 
 
 		 406 aa  677    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000367008 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0640  hypothetical protein  79.31 
 
 		 406 aa  671    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134735 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2989  hypothetical protein  77.83 
 
 		 406 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0594  hypothetical protein  73.45 
 
 		 406 aa  620  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.554902  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39050  hypothetical protein  62.32 
 
 		 406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01696  hypothetical protein  50.49 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2243  hypothetical protein  36.96 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1848  hypothetical protein  22.25 
 
 		 413 aa  98.2  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.688083  normal  0.266524 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4084  hypothetical protein  25.19 
 
 		 418 aa  97.1  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.460478  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2618  hypothetical protein  20.9 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>