12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3012 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3012  carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 414 aa  847    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.339715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0267  hypothetical protein  45.52 
 
 		 409 aa  350  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.254673  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2290  hypothetical protein  37.53 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3661  Carbohydrate-selective porin OprB  26.72 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3271  hypothetical protein  34.96 
 
 		 469 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0437682  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4912  Carbohydrate-selective porin OprB  31.48 
 
 		 456 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00363735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3835  Carbohydrate-selective porin OprB  31.48 
 
 		 456 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.899229 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3768  Carbohydrate-selective porin OprB  26.17 
 
 		 476 aa  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1632  putative porin B precursor outer (glucose porin) transmembrane protein  28.95 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4576  carbohydrate-selective porin OprB  26.77 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4360  carbohydrate-selective porin OprB  30 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.081551  normal  0.195321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1082  carbohydrate-selective porin OprB  30 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0774059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>