More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2379 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2379  thiazole biosynthesis family protein  100 
 
 
254 aa  522  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2588  thiazole biosynthesis family protein  82.68 
 
 
255 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59358  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2017  thiazole biosynthesis family protein  78.74 
 
 
254 aa  424  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.706865 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2197  thiazole synthase  77.56 
 
 
269 aa  408  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.156916  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2319  thiazole synthase  75.2 
 
 
254 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.789275  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2026  thiazole synthase  74.8 
 
 
254 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2028  thiazole synthase  75.2 
 
 
254 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224255 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1926  thiazole synthase  74.41 
 
 
254 aa  400  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2435  thiazole synthase  74.8 
 
 
254 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0679101  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2093  thiazole synthase  72.83 
 
 
254 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.61788 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2441  thiazole synthase  72.44 
 
 
254 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1885  thiazole synthase  72.33 
 
 
254 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1940  thiazole synthase  72.62 
 
 
252 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1774  thiazole synthase  73.52 
 
 
266 aa  391  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1856  thiazole synthase  74.31 
 
 
271 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2092  thiazole biosynthesis family protein  73.15 
 
 
257 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002076  thiazole biosynthesis protein ThiG  68.63 
 
 
255 aa  362  4e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00362  thiazole synthase  66.54 
 
 
255 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2389  thiazole biosynthesis family protein  67.33 
 
 
258 aa  352  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.673055  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0364  thiazole synthase  67.33 
 
 
265 aa  349  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0243  thiazole synthase  67.59 
 
 
258 aa  348  3e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4224  thiazole synthase  66.8 
 
 
256 aa  347  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4481  thiazole synthase  66.8 
 
 
256 aa  347  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03867  thiazole synthase  66.8 
 
 
256 aa  346  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4532  thiazole synthase  66.8 
 
 
256 aa  346  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03820  hypothetical protein  66.8 
 
 
256 aa  346  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3874  thiazole synthase  68.38 
 
 
259 aa  345  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0280  thiazole synthase  67.32 
 
 
259 aa  344  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0212  thiazole synthase  68.38 
 
 
261 aa  344  7e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4004  thiazole biosynthesis family protein  66.4 
 
 
256 aa  344  8.999999999999999e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4035  thiazole synthase  66.4 
 
 
256 aa  344  8.999999999999999e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937361 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5458  thiazole synthase  66.4 
 
 
271 aa  343  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.12937 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00142  thiazole synthase  65.08 
 
 
256 aa  342  4e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4438  thiazole synthase  65.61 
 
 
271 aa  341  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000032943 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0216  thiazole synthase  67.59 
 
 
260 aa  340  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4566  thiazole synthase  65.61 
 
 
261 aa  337  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592889 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0203  thiazole synthase  64.82 
 
 
256 aa  337  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2449  thiazole synthase  66.8 
 
 
256 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3719  thiazole biosynthesis family protein  67.19 
 
 
258 aa  335  5e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.782272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0451  thiazole synthase  63.5 
 
 
271 aa  334  5.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000248099 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3856  thiazole synthase  63.5 
 
 
271 aa  334  5.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0343  thiazole synthase  63.26 
 
 
271 aa  335  5.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4403  thiazole synthase  65.61 
 
 
256 aa  334  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2987  thiazole synthase  65.87 
 
 
256 aa  333  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0045  thiazole synthase  64.43 
 
 
259 aa  330  9e-90  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0368831  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4370  thiazole synthase  65.22 
 
 
256 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0625  thiazole biosynthesis family protein  64.03 
 
 
257 aa  330  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4490  thiazole synthase  64.82 
 
 
256 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2461  thiazole biosynthesis family protein  62.99 
 
 
255 aa  330  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2470  thiazole biosynthesis family protein  65.1 
 
 
255 aa  328  8e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4492  thiazole synthase  64.43 
 
 
261 aa  327  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.739018  hitchhiker  0.00000139222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6574  thiazole biosynthesis family protein  63.75 
 
 
259 aa  320  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1599  thiazole biosynthesis family protein  61.9 
 
 
258 aa  316  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.573571  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2108  thiazole synthase  58.27 
 
 
259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1821  thiazole synthase  54.37 
 
 
256 aa  285  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.105985 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0609  thiazole synthase  54.15 
 
 
258 aa  277  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0669108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0339  thiazole synthase  54.15 
 
 
258 aa  276  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1565  thiazole synthase  53.15 
 
 
275 aa  276  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0719115 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1267  thiazole synthase  53.41 
 
 
256 aa  276  3e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0716  thiazole synthase  56.47 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000103869  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1663  thiazole synthase  51.39 
 
 
255 aa  265  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000271771  hitchhiker  0.00109923 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2003  thiazole synthase  53.57 
 
 
259 aa  265  5e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0730  thiazole synthase  51.78 
 
 
259 aa  265  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0665  thiazole synthase  52.96 
 
 
259 aa  263  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1639  thiazole synthase  52.33 
 
 
277 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  52.9 
 
 
666 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  52.9 
 
 
666 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1836  thiazole synthase  53.57 
 
 
303 aa  258  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138321  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1556  thiazole synthase  51.97 
 
 
259 aa  257  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.765311  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0598  thiazole synthase  51 
 
 
255 aa  257  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0776  thiazole biosynthesis family protein  49.8 
 
 
263 aa  254  8e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18541  thiazole synthase  50.63 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1756  thiazole synthase  50.21 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1921  thiazole synthase  52 
 
 
267 aa  251  7e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.142518 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18731  thiazole synthase  50.63 
 
 
264 aa  251  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  53.12 
 
 
652 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  50.58 
 
 
652 aa  248  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2221  thiazole synthase  48.65 
 
 
279 aa  246  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0368  thiazole biosynthesis family protein  51.19 
 
 
265 aa  246  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.263226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1916  thiazole biosynthesis family protein  46.06 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0051  thiazole synthase  49.42 
 
 
273 aa  241  6e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0576  thiazole synthase  50.58 
 
 
286 aa  241  6e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.0505529 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00531  thiazole synthase  47.13 
 
 
306 aa  241  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3076  thiazole synthase  51.97 
 
 
337 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1571  thiazole synthase  49.6 
 
 
254 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.515175  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18541  thiazole synthase  47.27 
 
 
265 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.586364  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1854  thiazole synthase  49.6 
 
 
254 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.342014  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17901  thiazole synthase  46.92 
 
 
275 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00995921  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1189  thiazole synthase  46.25 
 
 
258 aa  236  3e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1555  thiazole synthase  48.22 
 
 
264 aa  235  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2043  thiazole biosynthesis family protein  48.81 
 
 
265 aa  234  7e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1066  thiazole synthase  45.85 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.192544  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0736  thiazole synthase  45.85 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  50 
 
 
684 aa  233  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1177  thiazole synthase  47.24 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1262  thiazole synthase  42.15 
 
 
268 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0727  thiazole biosynthesis family protein  47.62 
 
 
261 aa  232  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329122  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0410  thiazole biosynthesis family protein  49.19 
 
 
262 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21331  thiazole synthase  42.15 
 
 
268 aa  232  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0800  thiazole synthase  47.47 
 
 
266 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>