More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2197 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2197  thiazole synthase  100 
 
 		 269 aa  552  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.156916  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2379  thiazole biosynthesis family protein  77.56 
 
 		 254 aa  408  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1774  thiazole synthase  76.77 
 
 		 266 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2588  thiazole biosynthesis family protein  77.56 
 
 		 255 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59358  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2435  thiazole synthase  75.98 
 
 		 254 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2017  thiazole biosynthesis family protein  74.8 
 
 		 254 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.706865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2026  thiazole synthase  75.98 
 
 		 254 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2028  thiazole synthase  75.59 
 
 		 254 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2319  thiazole synthase  75.59 
 
 		 254 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.789275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1926  thiazole synthase  74.8 
 
 		 254 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1856  thiazole synthase  73.12 
 
 		 271 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2441  thiazole synthase  72.83 
 
 		 254 aa  384  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2092  thiazole biosynthesis family protein  72.76 
 
 		 257 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1885  thiazole synthase  72.44 
 
 		 254 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2093  thiazole synthase  72.83 
 
 		 254 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.61788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1940  thiazole synthase  73.02 
 
 		 252 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002076  thiazole biosynthesis protein ThiG  67.32 
 
 		 255 aa  358  5e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00362  thiazole synthase  66.93 
 
 		 255 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00142  thiazole synthase  66.15 
 
 		 256 aa  350  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0364  thiazole synthase  66.93 
 
 		 265 aa  346  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0243  thiazole synthase  65.22 
 
 		 258 aa  345  3e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2449  thiazole synthase  67.59 
 
 		 256 aa  343  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0280  thiazole synthase  64.96 
 
 		 259 aa  342  5.999999999999999e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0212  thiazole synthase  66.93 
 
 		 261 aa  340  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0216  thiazole synthase  66.93 
 
 		 260 aa  338  7e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0343  thiazole synthase  63.64 
 
 		 271 aa  337  8e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0451  thiazole synthase  63.64 
 
 		 271 aa  337  9e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000248099 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3856  thiazole synthase  63.64 
 
 		 271 aa  337  9e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0045  thiazole synthase  64.43 
 
 		 259 aa  336  1.9999999999999998e-91  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0368831  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2389  thiazole biosynthesis family protein  63.35 
 
 		 258 aa  335  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.673055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3719  thiazole biosynthesis family protein  65.22 
 
 		 258 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.782272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0625  thiazole biosynthesis family protein  64.03 
 
 		 257 aa  332  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3874  thiazole synthase  63.42 
 
 		 259 aa  330  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4532  thiazole synthase  64.29 
 
 		 256 aa  329  3e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4481  thiazole synthase  64.03 
 
 		 256 aa  328  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4224  thiazole synthase  64.03 
 
 		 256 aa  328  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4004  thiazole biosynthesis family protein  64.29 
 
 		 256 aa  328  6e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4035  thiazole synthase  64.29 
 
 		 256 aa  328  6e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937361 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03867  thiazole synthase  64.03 
 
 		 256 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5458  thiazole synthase  64.03 
 
 		 271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.12937 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03820  hypothetical protein  64.03 
 
 		 256 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2987  thiazole synthase  63.89 
 
 		 256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4566  thiazole synthase  63.1 
 
 		 261 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592889 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4438  thiazole synthase  63.1 
 
 		 271 aa  322  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000032943 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4403  thiazole synthase  63.1 
 
 		 256 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0203  thiazole synthase  64.29 
 
 		 256 aa  322  4e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2470  thiazole biosynthesis family protein  63.14 
 
 		 255 aa  322  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1599  thiazole biosynthesis family protein  60.63 
 
 		 258 aa  321  7e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.573571  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4490  thiazole synthase  62.85 
 
 		 256 aa  321  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00810094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2461  thiazole biosynthesis family protein  60.63 
 
 		 255 aa  320  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4492  thiazole synthase  62.45 
 
 		 261 aa  319  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.739018  hitchhiker  0.00000139222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4370  thiazole synthase  62.85 
 
 		 256 aa  318  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6574  thiazole biosynthesis family protein  60.96 
 
 		 259 aa  313  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2108  thiazole synthase  56.69 
 
 		 259 aa  299  4e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1821  thiazole synthase  56.57 
 
 		 256 aa  297  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.105985 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1565  thiazole synthase  55.12 
 
 		 275 aa  291  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0719115 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1267  thiazole synthase  57.43 
 
 		 256 aa  291  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0339  thiazole synthase  54.55 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0609  thiazole synthase  54.55 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0669108  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0716  thiazole synthase  57.48 
 
 		 260 aa  281  7.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000103869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2003  thiazole synthase  57.14 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0730  thiazole synthase  54.09 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0665  thiazole synthase  55.95 
 
 		 259 aa  270  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1639  thiazole synthase  54.05 
 
 		 277 aa  268  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1556  thiazole synthase  52.92 
 
 		 259 aa  261  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.765311  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1663  thiazole synthase  50.2 
 
 		 255 aa  261  8.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000271771  hitchhiker  0.00109923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1836  thiazole synthase  52.96 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138321  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  50.75 
 
 		 666 aa  255  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  50.75 
 
 		 666 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  51.74 
 
 		 652 aa  254  8e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0598  thiazole synthase  50.2 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1921  thiazole synthase  49.81 
 
 		 267 aa  252  6e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.142518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3076  thiazole synthase  51.28 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0776  thiazole biosynthesis family protein  49.21 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18541  thiazole synthase  48.81 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1756  thiazole synthase  48.81 
 
 		 264 aa  248  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  52.73 
 
 		 652 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00531  thiazole synthase  47.57 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18731  thiazole synthase  48.81 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1916  thiazole biosynthesis family protein  47.24 
 
 		 262 aa  246  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0051  thiazole synthase  49.81 
 
 		 273 aa  245  4e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17901  thiazole synthase  47.92 
 
 		 275 aa  245  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00995921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0410  thiazole biosynthesis family protein  49.59 
 
 		 262 aa  244  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2221  thiazole synthase  48.26 
 
 		 279 aa  244  8e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0054  thiazole synthase  48.66 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  50.19 
 
 		 684 aa  241  7.999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0576  thiazole synthase  49.43 
 
 		 286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.0505529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0368  thiazole biosynthesis family protein  46.92 
 
 		 265 aa  239  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.263226 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1262  thiazole synthase  45.38 
 
 		 268 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21331  thiazole synthase  45.38 
 
 		 268 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0800  thiazole synthase  47.86 
 
 		 266 aa  239  5e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1177  thiazole synthase  47.06 
 
 		 254 aa  238  6.999999999999999e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0727  thiazole biosynthesis family protein  47.62 
 
 		 261 aa  237  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1747  thiazole biosynthesis family protein  48.02 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00020742  normal  0.0183196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2043  thiazole biosynthesis family protein  47.69 
 
 		 265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1555  thiazole synthase  48.43 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0807  thiazole synthase  48.41 
 
 		 289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.304332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2781  thiazole synthase  48.18 
 
 		 252 aa  232  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0075  thiazole synthase  47.43 
 
 		 253 aa  232  5e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0073  thiazole biosynthesis family protein  50 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>