299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1836 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1836  thiazole synthase  100 
 
 
303 aa  589  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138321  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3076  thiazole synthase  85.71 
 
 
337 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0609  thiazole synthase  64.45 
 
 
258 aa  295  9e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0669108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0339  thiazole synthase  64.45 
 
 
258 aa  294  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1821  thiazole synthase  62.35 
 
 
256 aa  293  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.105985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0280  thiazole synthase  62.45 
 
 
259 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0045  thiazole synthase  59.68 
 
 
259 aa  289  3e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0368831  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0243  thiazole synthase  59.53 
 
 
258 aa  285  5e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3874  thiazole synthase  60.87 
 
 
259 aa  285  7e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0216  thiazole synthase  59.84 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2449  thiazole synthase  58.2 
 
 
256 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0625  thiazole biosynthesis family protein  60.47 
 
 
257 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002076  thiazole biosynthesis protein ThiG  58.1 
 
 
255 aa  281  7.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0364  thiazole synthase  56.81 
 
 
265 aa  281  8.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0212  thiazole synthase  60.47 
 
 
261 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2108  thiazole synthase  59.85 
 
 
259 aa  280  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4481  thiazole synthase  58.82 
 
 
256 aa  280  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4224  thiazole synthase  58.82 
 
 
256 aa  280  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00362  thiazole synthase  57.31 
 
 
255 aa  279  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0203  thiazole synthase  60.47 
 
 
256 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0294046 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4004  thiazole biosynthesis family protein  58.82 
 
 
256 aa  278  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4532  thiazole synthase  58.82 
 
 
256 aa  278  6e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4035  thiazole synthase  58.82 
 
 
256 aa  278  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937361 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1856  thiazole synthase  58.59 
 
 
271 aa  278  7e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5458  thiazole synthase  57.75 
 
 
271 aa  278  8e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.12937 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03867  thiazole synthase  58.43 
 
 
256 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03820  hypothetical protein  58.43 
 
 
256 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4438  thiazole synthase  58.43 
 
 
271 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000032943 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4566  thiazole synthase  57.81 
 
 
261 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592889 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0451  thiazole synthase  57.2 
 
 
271 aa  275  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000248099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0343  thiazole synthase  57.2 
 
 
271 aa  275  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3856  thiazole synthase  57.2 
 
 
271 aa  275  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4490  thiazole synthase  57.42 
 
 
256 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810094 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3719  thiazole biosynthesis family protein  59.68 
 
 
258 aa  275  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.782272  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4492  thiazole synthase  56.98 
 
 
261 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.739018  hitchhiker  0.00000139222 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4403  thiazole synthase  57.03 
 
 
256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1663  thiazole synthase  57.25 
 
 
255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000271771  hitchhiker  0.00109923 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4370  thiazole synthase  56.64 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1639  thiazole synthase  57.35 
 
 
277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2987  thiazole synthase  58.2 
 
 
256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0716  thiazole synthase  61.48 
 
 
260 aa  271  8.000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000103869  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2461  thiazole biosynthesis family protein  58.57 
 
 
255 aa  271  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2470  thiazole biosynthesis family protein  57.09 
 
 
255 aa  270  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1921  thiazole synthase  60.24 
 
 
267 aa  270  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.142518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6574  thiazole biosynthesis family protein  58.33 
 
 
259 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  56.2 
 
 
652 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1599  thiazole biosynthesis family protein  55.34 
 
 
258 aa  263  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.573571  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2017  thiazole biosynthesis family protein  55.29 
 
 
254 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.706865 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1774  thiazole synthase  54.75 
 
 
266 aa  262  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00142  thiazole synthase  55.38 
 
 
256 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0598  thiazole synthase  54.12 
 
 
255 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2389  thiazole biosynthesis family protein  56.08 
 
 
258 aa  260  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.673055  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2197  thiazole synthase  52.96 
 
 
269 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.156916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  55.26 
 
 
666 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  55.26 
 
 
666 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2588  thiazole biosynthesis family protein  53.33 
 
 
255 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59358  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2379  thiazole biosynthesis family protein  53.57 
 
 
254 aa  257  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0051  thiazole synthase  54.75 
 
 
273 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1926  thiazole synthase  54.51 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  54.65 
 
 
258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  55.43 
 
 
684 aa  253  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2093  thiazole synthase  55.95 
 
 
254 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.61788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1940  thiazole synthase  55.56 
 
 
252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2028  thiazole synthase  54.94 
 
 
254 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2319  thiazole synthase  54.94 
 
 
254 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.789275  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1885  thiazole synthase  55.95 
 
 
254 aa  252  6e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2435  thiazole synthase  54.55 
 
 
254 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0679101  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2026  thiazole synthase  54.55 
 
 
254 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0588  thiazole synthase  54.26 
 
 
260 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0054  thiazole synthase  55.47 
 
 
272 aa  251  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1136  thiazole synthase  55.09 
 
 
265 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0568809 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2092  thiazole biosynthesis family protein  55.65 
 
 
257 aa  248  9e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2441  thiazole synthase  53.97 
 
 
254 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1267  thiazole synthase  52.31 
 
 
256 aa  248  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2221  thiazole synthase  50 
 
 
279 aa  247  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0036  thiazole synthase  52.92 
 
 
259 aa  246  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.739485  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00531  thiazole synthase  52.85 
 
 
306 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18541  thiazole synthase  51.98 
 
 
264 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1269  thiazole synthase  51.95 
 
 
267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0262061  hitchhiker  0.00290038 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1262  thiazole synthase  48.85 
 
 
268 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1346  thiazole synthase  53.91 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1335  thiazole synthase  54.09 
 
 
257 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0200731  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0576  thiazole synthase  57.09 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.0505529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2518  thiazole synthase  54.3 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0776  thiazole biosynthesis family protein  53.05 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2043  thiazole biosynthesis family protein  57.03 
 
 
265 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1433  thiazole synthase  54.09 
 
 
257 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21331  thiazole synthase  48.46 
 
 
268 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2481  thiazole biosynthesis family protein  61.51 
 
 
259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.1272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0666  thiazole synthase  53.1 
 
 
260 aa  242  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0348700000000004e-26 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17901  thiazole synthase  50.38 
 
 
275 aa  241  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00995921  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18731  thiazole synthase  51.59 
 
 
264 aa  241  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0727  thiazole biosynthesis family protein  55.12 
 
 
261 aa  241  9e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329122  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0073  thiazole biosynthesis family protein  54.94 
 
 
257 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0368  thiazole biosynthesis family protein  55.85 
 
 
265 aa  240  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.263226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2934  thiazole synthase  52.14 
 
 
260 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00258312  hitchhiker  7.11375e-16 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  53.7 
 
 
329 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1756  thiazole synthase  50.39 
 
 
264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4167  thiazole synthase  52.71 
 
 
264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.64186  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0800  thiazole synthase  53.88 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>