More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4566 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4566  thiazole synthase  100 
 
 
261 aa  523  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592889 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4492  thiazole synthase  96.55 
 
 
261 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.739018  hitchhiker  0.00000139222 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4403  thiazole synthase  97.27 
 
 
256 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4490  thiazole synthase  97.27 
 
 
256 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810094 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4370  thiazole synthase  96.09 
 
 
256 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5458  thiazole synthase  93.05 
 
 
271 aa  484  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.12937 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4438  thiazole synthase  91.57 
 
 
271 aa  482  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000032943 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4004  thiazole biosynthesis family protein  93.36 
 
 
256 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4224  thiazole synthase  93.36 
 
 
256 aa  478  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4532  thiazole synthase  93.36 
 
 
256 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4035  thiazole synthase  93.36 
 
 
256 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937361 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4481  thiazole synthase  93.36 
 
 
256 aa  478  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03867  thiazole synthase  92.97 
 
 
256 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03820  hypothetical protein  92.97 
 
 
256 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0203  thiazole synthase  89.45 
 
 
256 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0280  thiazole synthase  77.78 
 
 
259 aa  394  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0212  thiazole synthase  78.66 
 
 
261 aa  394  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3874  thiazole synthase  78.66 
 
 
259 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3719  thiazole biosynthesis family protein  77.38 
 
 
258 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.782272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0216  thiazole synthase  77.87 
 
 
260 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0451  thiazole synthase  74.34 
 
 
271 aa  388  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000248099 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3856  thiazole synthase  74.34 
 
 
271 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0343  thiazole synthase  74.34 
 
 
271 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00362  thiazole synthase  71.37 
 
 
255 aa  378  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002076  thiazole biosynthesis protein ThiG  71.37 
 
 
255 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0045  thiazole synthase  70.24 
 
 
259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0368831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1856  thiazole synthase  69.96 
 
 
271 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0364  thiazole synthase  67.95 
 
 
265 aa  355  5e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2449  thiazole synthase  70.36 
 
 
256 aa  353  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2461  thiazole biosynthesis family protein  69.02 
 
 
255 aa  351  7e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6574  thiazole biosynthesis family protein  70.24 
 
 
259 aa  351  7e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2987  thiazole synthase  70.63 
 
 
256 aa  344  8.999999999999999e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2017  thiazole biosynthesis family protein  66.01 
 
 
254 aa  343  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.706865 
 
 
-
 
NC_002950  PG2108  thiazole synthase  66.41 
 
 
259 aa  340  2e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1926  thiazole synthase  65.22 
 
 
254 aa  337  8e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2379  thiazole biosynthesis family protein  65.61 
 
 
254 aa  337  9e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2588  thiazole biosynthesis family protein  65.22 
 
 
255 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59358  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0243  thiazole synthase  66.02 
 
 
258 aa  337  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2319  thiazole synthase  65.22 
 
 
254 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.789275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2028  thiazole synthase  65.22 
 
 
254 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2389  thiazole biosynthesis family protein  64.71 
 
 
258 aa  334  7e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.673055  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2435  thiazole synthase  64.82 
 
 
254 aa  334  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0679101  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2026  thiazole synthase  64.82 
 
 
254 aa  334  7e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2093  thiazole synthase  64.43 
 
 
254 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.61788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1885  thiazole synthase  64.43 
 
 
254 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1940  thiazole synthase  64.68 
 
 
252 aa  333  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0625  thiazole biosynthesis family protein  68.25 
 
 
257 aa  332  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00142  thiazole synthase  65.22 
 
 
256 aa  332  3e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2441  thiazole synthase  64.03 
 
 
254 aa  332  4e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1599  thiazole biosynthesis family protein  65.08 
 
 
258 aa  330  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.573571  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2470  thiazole biosynthesis family protein  65.49 
 
 
255 aa  328  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1774  thiazole synthase  64.31 
 
 
266 aa  327  9e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2197  thiazole synthase  63.1 
 
 
269 aa  323  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.156916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2092  thiazole biosynthesis family protein  64.71 
 
 
257 aa  319  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1821  thiazole synthase  59.52 
 
 
256 aa  295  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.105985 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0609  thiazole synthase  59.61 
 
 
258 aa  293  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0669108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0339  thiazole synthase  59.22 
 
 
258 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0716  thiazole synthase  60.39 
 
 
260 aa  281  6.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000103869  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1267  thiazole synthase  58.14 
 
 
256 aa  280  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1565  thiazole synthase  54.51 
 
 
275 aa  277  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0719115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1836  thiazole synthase  57.81 
 
 
303 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138321  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1663  thiazole synthase  56.18 
 
 
255 aa  273  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000271771  hitchhiker  0.00109923 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0730  thiazole synthase  54.9 
 
 
259 aa  269  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0665  thiazole synthase  56.47 
 
 
259 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2003  thiazole synthase  56.98 
 
 
259 aa  268  7e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00531  thiazole synthase  53.85 
 
 
306 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1639  thiazole synthase  55.04 
 
 
277 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  54.62 
 
 
666 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1921  thiazole synthase  55.56 
 
 
267 aa  258  7e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.142518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  54.62 
 
 
666 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3076  thiazole synthase  57.25 
 
 
337 aa  258  9e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1556  thiazole synthase  52.73 
 
 
259 aa  254  8e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.765311  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  55.47 
 
 
684 aa  253  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2221  thiazole synthase  52.34 
 
 
279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0051  thiazole synthase  53.23 
 
 
273 aa  251  8.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0598  thiazole synthase  50.79 
 
 
255 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  53.91 
 
 
652 aa  250  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0368  thiazole biosynthesis family protein  53.57 
 
 
265 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.263226 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0727  thiazole biosynthesis family protein  51.78 
 
 
261 aa  250  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329122  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1680  thiazole biosynthesis family protein  53.94 
 
 
263 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000440106  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2481  thiazole biosynthesis family protein  56.96 
 
 
259 aa  248  6e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.1272  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0776  thiazole biosynthesis family protein  50.39 
 
 
263 aa  248  8e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1756  thiazole synthase  49.22 
 
 
264 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17901  thiazole synthase  49.24 
 
 
275 aa  245  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00995921  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18541  thiazole synthase  49.22 
 
 
264 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3035  thiazole biosynthesis family protein  53.2 
 
 
272 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949992  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0054  thiazole synthase  53.46 
 
 
272 aa  245  4.9999999999999997e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2043  thiazole biosynthesis family protein  53.17 
 
 
265 aa  245  4.9999999999999997e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0410  thiazole biosynthesis family protein  52.44 
 
 
262 aa  245  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1262  thiazole synthase  48.08 
 
 
268 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0576  thiazole synthase  54.23 
 
 
286 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.0505529 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1916  thiazole biosynthesis family protein  47.83 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21331  thiazole synthase  48.08 
 
 
268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  55.43 
 
 
652 aa  242  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18731  thiazole synthase  48.84 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0036  thiazole synthase  49.6 
 
 
259 aa  238  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.739485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3659  thiazole synthase  48.63 
 
 
260 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0073  thiazole biosynthesis family protein  51.97 
 
 
257 aa  238  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  50.39 
 
 
267 aa  236  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1555  thiazole synthase  50.79 
 
 
264 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>