298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3076 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3076  thiazole synthase  100 
 
 
337 aa  637    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1836  thiazole synthase  85.99 
 
 
303 aa  418  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138321  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0609  thiazole synthase  63.92 
 
 
258 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0669108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0339  thiazole synthase  63.92 
 
 
258 aa  292  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1821  thiazole synthase  62.45 
 
 
256 aa  289  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.105985 
 
 
-
 
NC_002950  PG2108  thiazole synthase  57.75 
 
 
259 aa  278  1e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4438  thiazole synthase  57.14 
 
 
271 aa  275  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000032943 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0243  thiazole synthase  57.75 
 
 
258 aa  275  8e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4224  thiazole synthase  57.65 
 
 
256 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4481  thiazole synthase  57.65 
 
 
256 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0045  thiazole synthase  57.42 
 
 
259 aa  274  2.0000000000000002e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0368831  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0203  thiazole synthase  57.81 
 
 
256 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5458  thiazole synthase  57.14 
 
 
271 aa  273  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.12937 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4004  thiazole biosynthesis family protein  57.65 
 
 
256 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4035  thiazole synthase  57.65 
 
 
256 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937361 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4532  thiazole synthase  57.65 
 
 
256 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6574  thiazole biosynthesis family protein  57.36 
 
 
259 aa  272  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03867  thiazole synthase  57.25 
 
 
256 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4566  thiazole synthase  56.76 
 
 
261 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592889 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0280  thiazole synthase  59.68 
 
 
259 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03820  hypothetical protein  57.25 
 
 
256 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0625  thiazole biosynthesis family protein  58.5 
 
 
257 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002076  thiazole biosynthesis protein ThiG  55.34 
 
 
255 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1856  thiazole synthase  56.47 
 
 
271 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1921  thiazole synthase  60.94 
 
 
267 aa  270  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.142518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4370  thiazole synthase  57.25 
 
 
256 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0364  thiazole synthase  55.21 
 
 
265 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4490  thiazole synthase  57.65 
 
 
256 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810094 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4492  thiazole synthase  56.76 
 
 
261 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.739018  hitchhiker  0.00000139222 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00362  thiazole synthase  54.94 
 
 
255 aa  269  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3874  thiazole synthase  59.29 
 
 
259 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2449  thiazole synthase  56.52 
 
 
256 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4403  thiazole synthase  57.25 
 
 
256 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0212  thiazole synthase  58.89 
 
 
261 aa  265  8e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0343  thiazole synthase  56.32 
 
 
271 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0451  thiazole synthase  56.32 
 
 
271 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000248099 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1663  thiazole synthase  54.69 
 
 
255 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000271771  hitchhiker  0.00109923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3856  thiazole synthase  56.32 
 
 
271 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0216  thiazole synthase  58.27 
 
 
260 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1599  thiazole biosynthesis family protein  54.98 
 
 
258 aa  263  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.573571  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2197  thiazole synthase  51.28 
 
 
269 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.156916  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2461  thiazole biosynthesis family protein  54.94 
 
 
255 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  55 
 
 
652 aa  260  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2470  thiazole biosynthesis family protein  55.51 
 
 
255 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3719  thiazole biosynthesis family protein  58.1 
 
 
258 aa  260  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.782272  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  53.9 
 
 
666 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1639  thiazole synthase  55.3 
 
 
277 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  53.9 
 
 
666 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0716  thiazole synthase  58.98 
 
 
260 aa  258  8e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000103869  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2987  thiazole synthase  55.25 
 
 
256 aa  258  9e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2389  thiazole biosynthesis family protein  54.9 
 
 
258 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.673055  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1774  thiazole synthase  53.23 
 
 
266 aa  256  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0598  thiazole synthase  53.73 
 
 
255 aa  256  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00142  thiazole synthase  53.75 
 
 
256 aa  252  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2379  thiazole biosynthesis family protein  51.97 
 
 
254 aa  250  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21331  thiazole synthase  49.06 
 
 
268 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1262  thiazole synthase  49.43 
 
 
268 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2017  thiazole biosynthesis family protein  52.36 
 
 
254 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.706865 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0576  thiazole synthase  56.3 
 
 
286 aa  247  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.0505529 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18541  thiazole synthase  49.8 
 
 
264 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0588  thiazole synthase  53.1 
 
 
260 aa  245  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2588  thiazole biosynthesis family protein  50.98 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59358  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0051  thiazole synthase  52.99 
 
 
273 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1267  thiazole synthase  50.76 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  54.09 
 
 
258 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0666  thiazole synthase  53.31 
 
 
260 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0348700000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0036  thiazole synthase  51.56 
 
 
259 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.739485  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17901  thiazole synthase  49.62 
 
 
275 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00995921  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  53.46 
 
 
684 aa  243  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1940  thiazole synthase  53.94 
 
 
252 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00531  thiazole synthase  53.82 
 
 
306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18731  thiazole synthase  49.4 
 
 
264 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2043  thiazole biosynthesis family protein  56.69 
 
 
265 aa  242  7e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2093  thiazole synthase  53.94 
 
 
254 aa  242  7e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.61788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0368  thiazole biosynthesis family protein  56.08 
 
 
265 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.263226 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1885  thiazole synthase  53.94 
 
 
254 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2435  thiazole synthase  52.55 
 
 
254 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0679101  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2028  thiazole synthase  52.94 
 
 
254 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2026  thiazole synthase  52.55 
 
 
254 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2319  thiazole synthase  52.94 
 
 
254 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.789275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1926  thiazole synthase  52.94 
 
 
254 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0776  thiazole biosynthesis family protein  53.33 
 
 
263 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1756  thiazole synthase  49.21 
 
 
264 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1269  thiazole synthase  51.57 
 
 
267 aa  239  6.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0262061  hitchhiker  0.00290038 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  48.34 
 
 
652 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0800  thiazole synthase  54.26 
 
 
266 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  49.42 
 
 
267 aa  238  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0653  thiazole synthase  51.75 
 
 
260 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0614883  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2221  thiazole synthase  47.57 
 
 
279 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18541  thiazole synthase  48.45 
 
 
265 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.586364  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1136  thiazole synthase  53.85 
 
 
265 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0568809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2441  thiazole synthase  51.97 
 
 
254 aa  236  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1555  thiazole synthase  54.51 
 
 
264 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0480  thiazole synthase  53.91 
 
 
265 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4167  thiazole synthase  52.34 
 
 
264 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.64186  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2637  thiazole synthase  50.96 
 
 
259 aa  236  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04980  thiazole synthase  53.91 
 
 
265 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1565  thiazole synthase  50.19 
 
 
275 aa  235  7e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0719115 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2092  thiazole biosynthesis family protein  52.94 
 
 
257 aa  235  8e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0073  thiazole biosynthesis family protein  54.18 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>