298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2003 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2003  thiazole synthase  100 
 
 
259 aa  513  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1267  thiazole synthase  84.82 
 
 
256 aa  447  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0730  thiazole synthase  82.95 
 
 
259 aa  435  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1565  thiazole synthase  79.84 
 
 
275 aa  429  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0719115 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0665  thiazole synthase  83.33 
 
 
259 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1556  thiazole synthase  79.22 
 
 
259 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.765311  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2197  thiazole synthase  57.14 
 
 
269 aa  299  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.156916  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2026  thiazole synthase  56.52 
 
 
254 aa  292  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2435  thiazole synthase  56.52 
 
 
254 aa  292  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0679101  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1926  thiazole synthase  55.73 
 
 
254 aa  291  7e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2028  thiazole synthase  56.13 
 
 
254 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2319  thiazole synthase  56.13 
 
 
254 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.789275  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0364  thiazole synthase  56.25 
 
 
265 aa  288  6e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00362  thiazole synthase  55.16 
 
 
255 aa  285  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2092  thiazole biosynthesis family protein  56.47 
 
 
257 aa  285  7e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03867  thiazole synthase  57.09 
 
 
256 aa  284  8e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4438  thiazole synthase  56.42 
 
 
271 aa  285  8e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000032943 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03820  hypothetical protein  57.09 
 
 
256 aa  284  8e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4532  thiazole synthase  57.09 
 
 
256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4224  thiazole synthase  57.09 
 
 
256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1774  thiazole synthase  56.4 
 
 
266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4481  thiazole synthase  57.09 
 
 
256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1940  thiazole synthase  53.57 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2017  thiazole biosynthesis family protein  53.36 
 
 
254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.706865 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4004  thiazole biosynthesis family protein  57.09 
 
 
256 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2588  thiazole biosynthesis family protein  54.12 
 
 
255 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59358  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4035  thiazole synthase  57.09 
 
 
256 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00142  thiazole synthase  57.14 
 
 
256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5458  thiazole synthase  56.42 
 
 
271 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.12937 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002076  thiazole biosynthesis protein ThiG  54.76 
 
 
255 aa  281  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2441  thiazole synthase  54.37 
 
 
254 aa  281  9e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4566  thiazole synthase  56.98 
 
 
261 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2093  thiazole synthase  53.57 
 
 
254 aa  280  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.61788 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2379  thiazole biosynthesis family protein  53.36 
 
 
254 aa  279  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0280  thiazole synthase  54.69 
 
 
259 aa  279  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1885  thiazole synthase  52.78 
 
 
254 aa  278  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4492  thiazole synthase  56.59 
 
 
261 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.739018  hitchhiker  0.00000139222 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4490  thiazole synthase  57.25 
 
 
256 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810094 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4403  thiazole synthase  56.86 
 
 
256 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2449  thiazole synthase  56.35 
 
 
256 aa  276  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4370  thiazole synthase  56.86 
 
 
256 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2461  thiazole biosynthesis family protein  55.95 
 
 
255 aa  275  7e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1856  thiazole synthase  53.57 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0243  thiazole synthase  55.51 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1821  thiazole synthase  54.72 
 
 
256 aa  271  8.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.105985 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0203  thiazole synthase  55.51 
 
 
256 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1599  thiazole biosynthesis family protein  55.56 
 
 
258 aa  271  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.573571  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0216  thiazole synthase  55.16 
 
 
260 aa  269  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3719  thiazole biosynthesis family protein  53.97 
 
 
258 aa  268  5e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.782272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0212  thiazole synthase  55.16 
 
 
261 aa  267  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3874  thiazole synthase  53.57 
 
 
259 aa  267  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0343  thiazole synthase  53.82 
 
 
271 aa  266  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0451  thiazole synthase  53.82 
 
 
271 aa  266  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000248099 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3856  thiazole synthase  53.82 
 
 
271 aa  266  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0625  thiazole biosynthesis family protein  52.94 
 
 
257 aa  265  5e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0045  thiazole synthase  52.8 
 
 
259 aa  265  5.999999999999999e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0368831  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0339  thiazole synthase  52.94 
 
 
258 aa  263  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0609  thiazole synthase  52.94 
 
 
258 aa  264  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0669108  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2389  thiazole biosynthesis family protein  51.75 
 
 
258 aa  264  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.673055  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2470  thiazole biosynthesis family protein  54.72 
 
 
255 aa  264  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2987  thiazole synthase  53.97 
 
 
256 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6574  thiazole biosynthesis family protein  54.88 
 
 
259 aa  260  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2108  thiazole synthase  51.35 
 
 
259 aa  259  4e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0716  thiazole synthase  55.51 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000103869  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18541  thiazole synthase  48.82 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0051  thiazole synthase  50.19 
 
 
273 aa  252  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1756  thiazole synthase  48.82 
 
 
264 aa  252  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1836  thiazole synthase  51.92 
 
 
303 aa  251  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138321  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00531  thiazole synthase  50 
 
 
306 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18731  thiazole synthase  48.43 
 
 
264 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1639  thiazole synthase  50.59 
 
 
277 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17901  thiazole synthase  48.09 
 
 
275 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00995921  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0368  thiazole biosynthesis family protein  50.59 
 
 
265 aa  240  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.263226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  49.8 
 
 
652 aa  238  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1156  thiazole synthase  51.06 
 
 
258 aa  238  9e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00109697  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2043  thiazole biosynthesis family protein  50 
 
 
265 aa  237  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0598  thiazole synthase  49.21 
 
 
255 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0054  thiazole synthase  49.62 
 
 
272 aa  236  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2221  thiazole synthase  47.58 
 
 
279 aa  236  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  50.6 
 
 
684 aa  235  4e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1663  thiazole synthase  48.82 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000271771  hitchhiker  0.00109923 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3076  thiazole synthase  50.95 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  47.53 
 
 
666 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  47.53 
 
 
666 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18541  thiazole synthase  48.05 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.586364  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21331  thiazole synthase  46.15 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1262  thiazole synthase  46.15 
 
 
268 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1921  thiazole synthase  49.8 
 
 
267 aa  233  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.142518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  50.97 
 
 
652 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0075  thiazole synthase  47.27 
 
 
253 aa  230  2e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4104  thiazole biosynthesis family protein  49.4 
 
 
272 aa  226  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225759  decreased coverage  0.005774 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1177  thiazole synthase  46.67 
 
 
254 aa  226  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0666  thiazole synthase  46.48 
 
 
260 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0348700000000004e-26 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0576  thiazole synthase  46.74 
 
 
286 aa  225  6e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.0505529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3659  thiazole synthase  47.01 
 
 
260 aa  224  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0653  thiazole synthase  46.09 
 
 
260 aa  225  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0614883  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0807  thiazole synthase  47.43 
 
 
289 aa  224  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.304332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0410  thiazole biosynthesis family protein  49 
 
 
262 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1747  thiazole biosynthesis family protein  50.2 
 
 
257 aa  223  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00020742  normal  0.0183196 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1916  thiazole biosynthesis family protein  43.31 
 
 
262 aa  223  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>