19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6191 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6191  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  739    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5180  hypothetical protein  51.4 
 
 
367 aa  351  8.999999999999999e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4441  hypothetical protein  45.25 
 
 
339 aa  288  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0049757  decreased coverage  0.000185172 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5302  hypothetical protein  49.72 
 
 
351 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1855  hypothetical protein  40 
 
 
356 aa  232  8.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0699  hypothetical protein  39.61 
 
 
356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0806  hypothetical protein  43.12 
 
 
407 aa  217  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17060  hypothetical protein  37.54 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171953  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1368  hypothetical protein  36.81 
 
 
348 aa  166  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.801576  normal  0.161269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0969  hypothetical protein  36.45 
 
 
303 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7140  hypothetical protein  45.9 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0934  hypothetical protein  31.35 
 
 
308 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3312  hypothetical protein  27.57 
 
 
307 aa  94  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18270  hypothetical protein  32.44 
 
 
313 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1351  hypothetical protein  30.95 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0214722  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1775  Tetratricopeptide repeats containing protein  27.3 
 
 
787 aa  69.3  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.44034  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0391  tetratricopeptide repeat protein  26.37 
 
 
668 aa  67.8  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0390  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 
591 aa  55.1  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2170  hypothetical protein  24.39 
 
 
319 aa  53.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>