65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1775 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1775  Tetratricopeptide repeats containing protein  100 
 
 
787 aa  1618    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.44034  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0391  tetratricopeptide repeat protein  44.04 
 
 
668 aa  331  3e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1351  hypothetical protein  33.47 
 
 
311 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0214722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3312  hypothetical protein  34.12 
 
 
307 aa  107  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18270  hypothetical protein  33.2 
 
 
313 aa  99.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0934  hypothetical protein  31.76 
 
 
308 aa  97.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0390  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 
591 aa  94  9e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
444 aa  76.6  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  28.1 
 
 
1507 aa  74.7  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3313  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000795793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
843 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6191  hypothetical protein  27.24 
 
 
367 aa  69.3  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
481 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 
454 aa  68.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  28.95 
 
 
1328 aa  68.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 
568 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.63 
 
 
568 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.05 
 
 
767 aa  67.8  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  30.36 
 
 
919 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 
1215 aa  64.7  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  23.58 
 
 
725 aa  63.9  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  25.09 
 
 
493 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.2 
 
 
771 aa  62  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  23.27 
 
 
732 aa  62  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  25.44 
 
 
822 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
751 aa  62  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.97 
 
 
991 aa  60.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.43 
 
 
1186 aa  60.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
911 aa  58.5  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.12 
 
 
787 aa  58.5  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 
1105 aa  57.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  27.68 
 
 
311 aa  57  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  28.36 
 
 
672 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  24 
 
 
1044 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0699  hypothetical protein  42.86 
 
 
356 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  25.59 
 
 
977 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  26.11 
 
 
799 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  25.26 
 
 
680 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  26.69 
 
 
1039 aa  54.3  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1855  hypothetical protein  40 
 
 
356 aa  54.3  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.78 
 
 
885 aa  53.5  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
190 aa  53.9  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4441  hypothetical protein  38.82 
 
 
339 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0049757  decreased coverage  0.000185172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5180  hypothetical protein  37.21 
 
 
367 aa  52  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5349  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.89 
 
 
1016 aa  52  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553326  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 
1028 aa  52  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
924 aa  51.6  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.35 
 
 
1288 aa  51.2  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  25.72 
 
 
362 aa  50.8  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  29.78 
 
 
212 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.21 
 
 
1424 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 
785 aa  48.9  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17060  hypothetical protein  32.22 
 
 
343 aa  49.3  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171953  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 
443 aa  48.5  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.8 
 
 
968 aa  48.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  28.57 
 
 
825 aa  48.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
162 aa  47.8  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 
284 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0806  hypothetical protein  47.27 
 
 
407 aa  47.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1368  hypothetical protein  42.11 
 
 
348 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.801576  normal  0.161269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  21.9 
 
 
782 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  24.39 
 
 
1212 aa  45.8  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  28 
 
 
1290 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
814 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  31.82 
 
 
2145 aa  44.3  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>