18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1855 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1855  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  704    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0699  hypothetical protein  83.33 
 
 		 356 aa  558  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0806  hypothetical protein  82.82 
 
 		 407 aa  532  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7140  hypothetical protein  84.62 
 
 		 292 aa  282  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4441  hypothetical protein  45.24 
 
 		 339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0049757  decreased coverage  0.000185172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5180  hypothetical protein  42.15 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6191  hypothetical protein  40 
 
 		 367 aa  232  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17060  hypothetical protein  39.83 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171953  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5302  hypothetical protein  46.8 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0969  hypothetical protein  41.38 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1368  hypothetical protein  37.5 
 
 		 348 aa  146  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.801576  normal  0.161269 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3312  hypothetical protein  28.45 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0934  hypothetical protein  31.76 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1351  hypothetical protein  34.63 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0214722  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18270  hypothetical protein  30.08 
 
 		 313 aa  86.3  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0391  tetratricopeptide repeat protein  26.32 
 
 		 668 aa  70.1  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0390  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 591 aa  66.6  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1775  Tetratricopeptide repeats containing protein  40 
 
 		 787 aa  54.3  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.44034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>