18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1351 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1351  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  638    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0214722  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0934  hypothetical protein  43.46 
 
 
308 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3312  hypothetical protein  41.88 
 
 
307 aa  264  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18270  hypothetical protein  35.67 
 
 
313 aa  182  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0391  tetratricopeptide repeat protein  32.93 
 
 
668 aa  177  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0390  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 
591 aa  169  5e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1775  Tetratricopeptide repeats containing protein  42.68 
 
 
787 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.44034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5180  hypothetical protein  32.37 
 
 
367 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0699  hypothetical protein  35.9 
 
 
356 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1855  hypothetical protein  34.63 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4441  hypothetical protein  30.65 
 
 
339 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0049757  decreased coverage  0.000185172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6191  hypothetical protein  30.95 
 
 
367 aa  82.8  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0806  hypothetical protein  31.98 
 
 
407 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17060  hypothetical protein  31.69 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171953  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1368  hypothetical protein  28.01 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.801576  normal  0.161269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0969  hypothetical protein  28.79 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5302  hypothetical protein  35.25 
 
 
351 aa  55.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7140  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>