19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17060 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_17060  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  672    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171953  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0969  hypothetical protein  49.16 
 
 		 303 aa  228  9e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5180  hypothetical protein  40.06 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4441  hypothetical protein  40.6 
 
 		 339 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0049757  decreased coverage  0.000185172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1368  hypothetical protein  44.24 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.801576  normal  0.161269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1855  hypothetical protein  39.83 
 
 		 356 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0806  hypothetical protein  43.24 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6191  hypothetical protein  37.54 
 
 		 367 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0699  hypothetical protein  40.97 
 
 		 356 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5302  hypothetical protein  48.19 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7140  hypothetical protein  42.55 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3312  hypothetical protein  29.8 
 
 		 307 aa  99.8  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0934  hypothetical protein  30.4 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0390  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 591 aa  92  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1351  hypothetical protein  31.69 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0214722  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18270  hypothetical protein  29.96 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0391  tetratricopeptide repeat protein  26.1 
 
 		 668 aa  65.1  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1775  Tetratricopeptide repeats containing protein  32.22 
 
 		 787 aa  49.3  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.44034  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2890  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.33 
 
 		 553 aa  42.7  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>