17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0969 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0969  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  582  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17060  hypothetical protein  49.16 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171953  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1368  hypothetical protein  46.92 
 
 
348 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.801576  normal  0.161269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1855  hypothetical protein  41.38 
 
 
356 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5180  hypothetical protein  38.51 
 
 
367 aa  178  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4441  hypothetical protein  39.41 
 
 
339 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0049757  decreased coverage  0.000185172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0699  hypothetical protein  41.82 
 
 
356 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0806  hypothetical protein  42.35 
 
 
407 aa  166  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6191  hypothetical protein  36.45 
 
 
367 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5302  hypothetical protein  42.12 
 
 
351 aa  145  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7140  hypothetical protein  43.33 
 
 
292 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3312  hypothetical protein  26.2 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0934  hypothetical protein  27.27 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18270  hypothetical protein  27.69 
 
 
313 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1351  hypothetical protein  28.79 
 
 
311 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0214722  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0390  TPR repeat-containing protein  20.53 
 
 
591 aa  50.8  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0391  tetratricopeptide repeat protein  26.61 
 
 
668 aa  47.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>