18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1368 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1368  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  676    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.801576  normal  0.161269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0969  hypothetical protein  47.7 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17060  hypothetical protein  44.35 
 
 		 343 aa  222  7e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5180  hypothetical protein  36.8 
 
 		 367 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6191  hypothetical protein  37.5 
 
 		 367 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4441  hypothetical protein  33.53 
 
 		 339 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0049757  decreased coverage  0.000185172 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1855  hypothetical protein  35.05 
 
 		 356 aa  160  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0699  hypothetical protein  36.31 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5302  hypothetical protein  39.71 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0806  hypothetical protein  37.78 
 
 		 407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3312  hypothetical protein  25.59 
 
 		 307 aa  90.1  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7140  hypothetical protein  38.17 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18270  hypothetical protein  28.69 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0390  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 591 aa  75.1  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0934  hypothetical protein  26.35 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1351  hypothetical protein  28.98 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0214722  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0391  tetratricopeptide repeat protein  27.13 
 
 		 668 aa  57.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1775  Tetratricopeptide repeats containing protein  37.65 
 
 		 787 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.44034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>