14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7140 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7140  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  573  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1855  hypothetical protein  86.03 
 
 
356 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0806  hypothetical protein  84.92 
 
 
407 aa  301  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0699  hypothetical protein  85.47 
 
 
356 aa  282  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5180  hypothetical protein  46.96 
 
 
367 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4441  hypothetical protein  42.92 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0049757  decreased coverage  0.000185172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6191  hypothetical protein  45.9 
 
 
367 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5302  hypothetical protein  51.65 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0969  hypothetical protein  43.33 
 
 
303 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17060  hypothetical protein  42.55 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171953  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1368  hypothetical protein  37.91 
 
 
348 aa  89.4  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.801576  normal  0.161269 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0934  hypothetical protein  34.23 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3312  hypothetical protein  27.5 
 
 
307 aa  58.9  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1351  hypothetical protein  33.33 
 
 
311 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0214722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>