18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0934 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0934  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  645    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3312  hypothetical protein  47.68 
 
 		 307 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1351  hypothetical protein  43.46 
 
 		 311 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0214722  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18270  hypothetical protein  41.75 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0391  tetratricopeptide repeat protein  35.74 
 
 		 668 aa  191  2e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0390  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 		 591 aa  189  7e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5180  hypothetical protein  31.02 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6191  hypothetical protein  31.35 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1855  hypothetical protein  31.76 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0699  hypothetical protein  32.35 
 
 		 356 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1775  Tetratricopeptide repeats containing protein  31.76 
 
 		 787 aa  97.4  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.44034  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0806  hypothetical protein  33.03 
 
 		 407 aa  96.3  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17060  hypothetical protein  30.4 
 
 		 343 aa  92.4  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4441  hypothetical protein  29.83 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0049757  decreased coverage  0.000185172 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5302  hypothetical protein  29.72 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1368  hypothetical protein  26.35 
 
 		 348 aa  67  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.801576  normal  0.161269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7140  hypothetical protein  34.23 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0969  hypothetical protein  27.27 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0136241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>