18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0699 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0699  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  694    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1855  hypothetical protein  83.33 
 
 
356 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0806  hypothetical protein  82.54 
 
 
407 aa  511  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7140  hypothetical protein  84.07 
 
 
292 aa  282  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4441  hypothetical protein  45.35 
 
 
339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0049757  decreased coverage  0.000185172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5180  hypothetical protein  44.75 
 
 
367 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6191  hypothetical protein  39.61 
 
 
367 aa  232  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5302  hypothetical protein  46.98 
 
 
351 aa  205  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17060  hypothetical protein  40.97 
 
 
343 aa  190  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171953  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0969  hypothetical protein  42.31 
 
 
303 aa  185  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1368  hypothetical protein  34.48 
 
 
348 aa  143  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.801576  normal  0.161269 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3312  hypothetical protein  30.6 
 
 
307 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0934  hypothetical protein  32.35 
 
 
308 aa  97.1  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1351  hypothetical protein  35.9 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0214722  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18270  hypothetical protein  31.78 
 
 
313 aa  86.7  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0391  tetratricopeptide repeat protein  27.69 
 
 
668 aa  71.6  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0390  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 
591 aa  70.1  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1775  Tetratricopeptide repeats containing protein  42.86 
 
 
787 aa  56.2  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.44034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>