23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5434 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5434  hypothetical protein  100 
 
 
513 aa  1030    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8940  putative integral membrane protein  60.27 
 
 
519 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0680972  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0035  putative integral membrane protein  33.13 
 
 
500 aa  224  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7297  putative integral membrane protein  35.57 
 
 
500 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0189864 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0819  hypothetical protein  32.72 
 
 
486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0443  hypothetical protein  32.72 
 
 
487 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06750  hypothetical protein  30.84 
 
 
487 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2242  hypothetical protein  27.11 
 
 
501 aa  146  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00170  putative integral membrane protein  30.41 
 
 
487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0686  hypothetical protein  31.25 
 
 
503 aa  130  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4503  hypothetical protein  26.65 
 
 
502 aa  119  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4712  hypothetical protein  26.62 
 
 
521 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188886  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4558  narrowly conserved hypothetical protein  29.56 
 
 
502 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.167516 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4214  hypothetical protein  28.47 
 
 
502 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4278  hypothetical protein  29.6 
 
 
503 aa  106  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5523  hypothetical protein  26.4 
 
 
489 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941713  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06460  hypothetical protein  23.75 
 
 
529 aa  94.7  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.381999  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1340  hypothetical protein  27.87 
 
 
514 aa  90.1  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8297  hypothetical protein  25 
 
 
509 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0369  hypothetical protein  24.82 
 
 
495 aa  86.7  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1571  hypothetical protein  25.7 
 
 
502 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321873  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3323  hypothetical protein  25.63 
 
 
566 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34323  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4944  hypothetical protein  24.29 
 
 
502 aa  60.5  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>