23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06750 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_06750  hypothetical protein  100 
 
 
487 aa  968    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00170  putative integral membrane protein  96.3 
 
 
487 aa  882    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0819  hypothetical protein  65.36 
 
 
486 aa  617  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0443  hypothetical protein  41.81 
 
 
487 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0035  putative integral membrane protein  32.59 
 
 
500 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7297  putative integral membrane protein  32.65 
 
 
500 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0189864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8940  putative integral membrane protein  29.12 
 
 
519 aa  150  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0680972  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5434  hypothetical protein  30.68 
 
 
513 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06460  hypothetical protein  25.81 
 
 
529 aa  142  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.381999  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1340  hypothetical protein  30.43 
 
 
514 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0686  hypothetical protein  26.84 
 
 
503 aa  107  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8297  hypothetical protein  24.26 
 
 
509 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2242  hypothetical protein  24.18 
 
 
501 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4214  hypothetical protein  27.76 
 
 
502 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3323  hypothetical protein  26.52 
 
 
566 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34323  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4558  narrowly conserved hypothetical protein  27.29 
 
 
502 aa  77  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.167516 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4503  hypothetical protein  27.34 
 
 
502 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1571  hypothetical protein  23.86 
 
 
502 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321873  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4712  hypothetical protein  21.83 
 
 
521 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188886  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4278  hypothetical protein  25.69 
 
 
503 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0369  hypothetical protein  23.54 
 
 
495 aa  59.7  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5523  hypothetical protein  23.01 
 
 
489 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941713  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4944  hypothetical protein  22.9 
 
 
502 aa  51.2  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>