22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7297 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0035  putative integral membrane protein  91.6 
 
 		 500 aa  937    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7297  putative integral membrane protein  100 
 
 		 500 aa  1004    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0189864 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06750  hypothetical protein  33.4 
 
 		 487 aa  241  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00170  putative integral membrane protein  33.6 
 
 		 487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0819  hypothetical protein  32.38 
 
 		 486 aa  228  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8940  putative integral membrane protein  34.85 
 
 		 519 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0680972  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0443  hypothetical protein  33.19 
 
 		 487 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5434  hypothetical protein  35.34 
 
 		 513 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1340  hypothetical protein  28.82 
 
 		 514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8297  hypothetical protein  27.89 
 
 		 509 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06460  hypothetical protein  26.04 
 
 		 529 aa  104  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.381999  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5523  hypothetical protein  26.95 
 
 		 489 aa  94.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0686  hypothetical protein  27.73 
 
 		 503 aa  90.1  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4503  hypothetical protein  24.71 
 
 		 502 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4214  hypothetical protein  25.29 
 
 		 502 aa  87  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3323  hypothetical protein  23.95 
 
 		 566 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34323  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4558  narrowly conserved hypothetical protein  24.82 
 
 		 502 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.167516 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0369  hypothetical protein  25.78 
 
 		 495 aa  79  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4712  hypothetical protein  23.56 
 
 		 521 aa  75.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2242  hypothetical protein  24.46 
 
 		 501 aa  70.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4278  hypothetical protein  23.66 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1571  hypothetical protein  26.54 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>