13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1340 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1340  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  998    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3323  hypothetical protein  40.53 
 
 		 566 aa  306  6e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34323  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0035  putative integral membrane protein  29.75 
 
 		 500 aa  131  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06750  hypothetical protein  30.61 
 
 		 487 aa  127  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7297  putative integral membrane protein  28.82 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0189864 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0819  hypothetical protein  31.2 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00170  putative integral membrane protein  29.7 
 
 		 487 aa  117  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0443  hypothetical protein  29.39 
 
 		 487 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5434  hypothetical protein  28.54 
 
 		 513 aa  85.9  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8940  putative integral membrane protein  25.56 
 
 		 519 aa  70.1  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0680972  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0204  hypothetical protein  31.58 
 
 		 399 aa  55.5  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.706683  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06460  hypothetical protein  24.11 
 
 		 529 aa  51.2  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.381999  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5523  hypothetical protein  24.87 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>