20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5523 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5523  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  983    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4503  hypothetical protein  35.98 
 
 		 502 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4214  hypothetical protein  35.15 
 
 		 502 aa  233  7.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4558  narrowly conserved hypothetical protein  35.1 
 
 		 502 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.167516 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4278  hypothetical protein  34.89 
 
 		 503 aa  206  7e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0369  hypothetical protein  29.22 
 
 		 495 aa  162  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8940  putative integral membrane protein  26.39 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0680972  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0035  putative integral membrane protein  26.43 
 
 		 500 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4944  hypothetical protein  29.03 
 
 		 502 aa  96.7  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7297  putative integral membrane protein  25.36 
 
 		 500 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0189864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5434  hypothetical protein  25.3 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0819  hypothetical protein  26.69 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0686  hypothetical protein  24.51 
 
 		 503 aa  60.1  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06460  hypothetical protein  23.43 
 
 		 529 aa  59.7  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.381999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0443  hypothetical protein  24.35 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00170  putative integral membrane protein  22.08 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06750  hypothetical protein  22.57 
 
 		 487 aa  51.6  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4712  hypothetical protein  21.09 
 
 		 521 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1340  hypothetical protein  24.1 
 
 		 514 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2242  hypothetical protein  21.4 
 
 		 501 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>