16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0686 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0686  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  967    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2242  hypothetical protein  47.76 
 
 
501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4712  hypothetical protein  46.35 
 
 
521 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188886  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1571  hypothetical protein  52.6 
 
 
502 aa  425  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8940  putative integral membrane protein  31.29 
 
 
519 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0680972  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5434  hypothetical protein  31.33 
 
 
513 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0035  putative integral membrane protein  28.21 
 
 
500 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06750  hypothetical protein  26.93 
 
 
487 aa  91.3  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7297  putative integral membrane protein  27.02 
 
 
500 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0189864 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00170  putative integral membrane protein  27.23 
 
 
487 aa  83.6  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0819  hypothetical protein  26.67 
 
 
486 aa  79  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0443  hypothetical protein  25.52 
 
 
487 aa  57  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5523  hypothetical protein  24.25 
 
 
489 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941713  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4278  hypothetical protein  24.75 
 
 
503 aa  47.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06460  hypothetical protein  27.17 
 
 
529 aa  45.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.381999  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4214  hypothetical protein  23.93 
 
 
502 aa  44.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>