17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1571 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008697  Noca_4712  hypothetical protein  68.14 
 
 
521 aa  721    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188886  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1571  hypothetical protein  100 
 
 
502 aa  990    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0686  hypothetical protein  52.6 
 
 
503 aa  488  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2242  hypothetical protein  43.57 
 
 
501 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8940  putative integral membrane protein  30.62 
 
 
519 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0680972  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5434  hypothetical protein  25.9 
 
 
513 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0819  hypothetical protein  28.17 
 
 
486 aa  95.5  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0035  putative integral membrane protein  25.88 
 
 
500 aa  94  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06750  hypothetical protein  22 
 
 
487 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00170  putative integral membrane protein  23.27 
 
 
487 aa  71.2  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7297  putative integral membrane protein  23.87 
 
 
500 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0189864 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0443  hypothetical protein  23.03 
 
 
487 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4558  narrowly conserved hypothetical protein  24.77 
 
 
502 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.167516 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4278  hypothetical protein  25.42 
 
 
503 aa  53.9  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5523  hypothetical protein  24.58 
 
 
489 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941713  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4214  hypothetical protein  24.77 
 
 
502 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4503  hypothetical protein  24.47 
 
 
502 aa  44.3  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>