10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3323 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3323  hypothetical protein  100 
 
 		 566 aa  1087    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34323  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1340  hypothetical protein  40.35 
 
 		 514 aa  299  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0035  putative integral membrane protein  24.94 
 
 		 500 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7297  putative integral membrane protein  22.1 
 
 		 500 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0189864 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0443  hypothetical protein  26.68 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0819  hypothetical protein  26.6 
 
 		 486 aa  76.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06750  hypothetical protein  24.3 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5434  hypothetical protein  24.94 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8940  putative integral membrane protein  24.47 
 
 		 519 aa  53.5  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0680972  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8297  hypothetical protein  24.31 
 
 		 509 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>