20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3022 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3022  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  874    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  normal  0.290235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2330  hypothetical protein  30.66 
 
 
451 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0215  hypothetical protein  28.92 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0466  hypothetical protein  44.72 
 
 
496 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.202142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1279  putative secreted protein  40.32 
 
 
257 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5975  hypothetical protein  43.64 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3120  hypothetical protein  31.54 
 
 
141 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0135  hypothetical protein  30.43 
 
 
402 aa  61.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  36.9 
 
 
2272 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  35.23 
 
 
2179 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  34 
 
 
1859 aa  52.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  40.32 
 
 
2136 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2448  hypothetical protein  37.5 
 
 
122 aa  49.7  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3676  BigA  43.33 
 
 
1940 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3847  porin, autotransporter  43.33 
 
 
1923 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3785  porin autotransporter  43.33 
 
 
1941 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3678  BigA  43.33 
 
 
1982 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0053  hypothetical protein  39.51 
 
 
122 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000536979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0462  hypothetical protein  29.89 
 
 
467 aa  43.9  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.449447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  25.6 
 
 
2449 aa  43.5  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>