13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0215 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0215  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  885    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2330  hypothetical protein  29.72 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0466  hypothetical protein  42.73 
 
 
496 aa  94  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.202142 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0462  hypothetical protein  43.52 
 
 
467 aa  87  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.449447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3022  hypothetical protein  37.61 
 
 
439 aa  80.1  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  normal  0.290235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5975  hypothetical protein  42.59 
 
 
156 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3120  hypothetical protein  34.35 
 
 
141 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1279  putative secreted protein  39.13 
 
 
257 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0135  hypothetical protein  31.88 
 
 
402 aa  63.9  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  30.88 
 
 
2914 aa  55.1  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  31.63 
 
 
2179 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  29.91 
 
 
2272 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2448  hypothetical protein  36 
 
 
122 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>