159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1030 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1030  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 		 79 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  57.75 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0246  ATP synthase F0, C subunit  61.84 
 
 		 78 aa  76.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.701859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0198  ATP synthase F0, C subunit  64 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000179911  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  50.67 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  50.67 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  50.67 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  50.67 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  49.33 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  49.33 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  49.33 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  49.33 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  45.59 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  50.77 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  58.33 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  48.57 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  50.94 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  50.94 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2850  ATP synthase F0, C subunit  44.29 
 
 		 185 aa  57  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0959232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  40.3 
 
 		 73 aa  57  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  40.54 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  39.39 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  47.3 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  47.69 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  40.54 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  49.09 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  50.94 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  50.94 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  47.37 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  49.06 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  49.06 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  43.86 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  41.79 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  52 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  41.03 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  50.98 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  45.61 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  43.4 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  47.17 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2849  F0F1 ATP synthase subunit C  52.11 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  44.62 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  44.62 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  46.15 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  46.15 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  46.15 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  36.84 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 		 321 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  50.98 
 
 		 81 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1166  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214234  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  46.43 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  43.64 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  54 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 		 75 aa  50.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 		 79 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  40.35 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  39.39 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  39.06 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1389  ATP synthase F0, C subunit  52 
 
 		 109 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  49.25 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  48 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1435  F0F1 ATP synthase subunit C  41.79 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213661  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  41.79 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  36.84 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  46.43 
 
 		 88 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2067  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.107619 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0947  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0801028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  49.09 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2701  ATP synthase F0, C subunit  48 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.025291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  44.78 
 
 		 76 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  49.09 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  40.32 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  44.62 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2097  ATP synthase F0, C subunit  47.27 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.887502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  40.35 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  43.06 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  39.62 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  51.06 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  46.27 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0134  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.28 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.331941  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  39.19 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.599204 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>