142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4562 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4562  phosphotransferase domain-containing protein  100 
 
 		 246 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.165591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0837  PHP domain protein  29.82 
 
 		 203 aa  85.5  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  27.6 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000619827  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  29.17 
 
 		 573 aa  72.8  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  28.45 
 
 		 574 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  22.94 
 
 		 572 aa  68.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1948  PHP domain protein  29.69 
 
 		 576 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.453444  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  28.57 
 
 		 642 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  29.91 
 
 		 574 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0618  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.57 
 
 		 740 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138492  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1038  histidinol-phosphatase  29.15 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  26.75 
 
 		 588 aa  63.5  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13892  hypothetical protein  31.98 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4386  phosphotransferase domain-containing protein  28.07 
 
 		 588 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1814  PHP domain protein  26.67 
 
 		 571 aa  63.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873874  normal  0.593252 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  27.4 
 
 		 557 aa  62.8  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  27.85 
 
 		 574 aa  62.4  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  24.41 
 
 		 574 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  28.14 
 
 		 650 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  26.75 
 
 		 614 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  27.16 
 
 		 583 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5061  hypothetical protein  27.57 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5149  hypothetical protein  27.57 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  27.57 
 
 		 584 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2025  PHP domain protein  23.08 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0754  HisJ family histidinol phosphate phosphatase  24.31 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.511615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5687  hypothetical protein  29.66 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1121  hypothetical protein  30.08 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  26.91 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1131  PHP domain protein  27.35 
 
 		 532 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  28.94 
 
 		 574 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3374  PHP domain protein  29.46 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5440  hypothetical protein  27.16 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.763333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1202  hypothetical protein  22.27 
 
 		 570 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1224  hypothetical protein  22.27 
 
 		 570 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4795  PHP domain protein  33.33 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  23.98 
 
 		 577 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  22.12 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  24.77 
 
 		 573 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  24.77 
 
 		 572 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  24.77 
 
 		 572 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  22.43 
 
 		 580 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0940  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  26.38 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  24.77 
 
 		 572 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  24.77 
 
 		 572 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  24.77 
 
 		 572 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1057  histidinol-phosphate phosphatase  23.35 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  24.77 
 
 		 573 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  24.77 
 
 		 573 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22620  PHP family phosphohydrolase, histidinol phosphatase  33.93 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552879  normal  0.391738 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  25.11 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2447  PHP domain protein  25.55 
 
 		 580 aa  55.5  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  24.2 
 
 		 578 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  24.3 
 
 		 572 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  24.77 
 
 		 573 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0726  hypothetical protein  24.24 
 
 		 569 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  24.77 
 
 		 572 aa  55.1  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  24.47 
 
 		 570 aa  55.1  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1748  PHP-like  28.91 
 
 		 650 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00399585  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0709  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  23.81 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000475894  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  26.05 
 
 		 570 aa  55.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  24.77 
 
 		 562 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  24.66 
 
 		 569 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  21.33 
 
 		 576 aa  53.9  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  25.56 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0395  hypothetical protein  28.05 
 
 		 339 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  26.55 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1901  PHP domain protein  30.59 
 
 		 347 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  23.96 
 
 		 578 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  24.56 
 
 		 576 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4410  PHP domain protein  26.87 
 
 		 582 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.969464 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4543  PHP domain protein  26.87 
 
 		 582 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00710379 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  26.61 
 
 		 598 aa  52.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4117  phosphotransferase domain-containing protein  28.39 
 
 		 592 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1786  phosphotransferase domain-containing protein  23.98 
 
 		 543 aa  52  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  24.24 
 
 		 245 aa  52  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  24.54 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  20.87 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000108896  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3642  phosphotransferase domain-containing protein  29.94 
 
 		 592 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  22.83 
 
 		 570 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  22.17 
 
 		 586 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1064  hypothetical protein  29.63 
 
 		 339 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1449  histidinol-phosphatase  25.11 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000100301  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  25.45 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  0.000044786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4395  hypothetical protein  27.03 
 
 		 337 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2830  PHP domain protein  24.41 
 
 		 577 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2986  PHP domain protein  27.78 
 
 		 577 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  23.95 
 
 		 584 aa  49.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  24.89 
 
 		 580 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  0.000000000565114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0665  histidinol-phosphatase  23.05 
 
 		 268 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  28.45 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  25.22 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0204  histidinol-phosphatase  26.59 
 
 		 269 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  24.11 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1798  family X DNA polymerase IV  26.67 
 
 		 589 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2044  PHP domain protein  23.21 
 
 		 557 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1723  PHP domain protein  27.48 
 
 		 560 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00699818  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1075  PHP domain protein  23.72 
 
 		 584 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0198  hypothetical protein  27.31 
 
 		 356 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  24.24 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>