123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0837 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0837  PHP domain protein  100 
 
 		 203 aa  422  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4562  phosphotransferase domain-containing protein  29.82 
 
 		 246 aa  85.5  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.165591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  28.22 
 
 		 572 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  27.72 
 
 		 572 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  27.72 
 
 		 572 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  27.72 
 
 		 572 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  27.72 
 
 		 572 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  27.72 
 
 		 572 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  27.72 
 
 		 573 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  27.72 
 
 		 573 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  28.08 
 
 		 573 aa  79.7  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  27.72 
 
 		 573 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  27.23 
 
 		 573 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  27.23 
 
 		 572 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  28.99 
 
 		 572 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  28.22 
 
 		 576 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  27.17 
 
 		 584 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  27.86 
 
 		 570 aa  73.9  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0726  hypothetical protein  30.36 
 
 		 569 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  29.76 
 
 		 574 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1814  PHP domain protein  26.5 
 
 		 571 aa  71.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873874  normal  0.593252 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  32.35 
 
 		 574 aa  68.6  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  28.02 
 
 		 570 aa  68.2  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1202  hypothetical protein  29.07 
 
 		 570 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1224  hypothetical protein  29.07 
 
 		 570 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  24.52 
 
 		 584 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1302  phosphotransferase domain-containing protein  26.92 
 
 		 589 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  29.48 
 
 		 574 aa  65.9  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2560  phosphoesterase, PHP-like  27.59 
 
 		 592 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.708367  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  29.9 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5061  hypothetical protein  26.13 
 
 		 334 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5149  hypothetical protein  26.13 
 
 		 334 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  26.79 
 
 		 578 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1121  hypothetical protein  26.63 
 
 		 334 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  30.41 
 
 		 574 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0198  hypothetical protein  26.29 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  23.85 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5440  hypothetical protein  25.63 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.763333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  28.79 
 
 		 576 aa  63.9  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1288  PHP domain protein  28.02 
 
 		 592 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0703959  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1389  PHP domain protein  28.02 
 
 		 592 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1064  hypothetical protein  27.14 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  26.47 
 
 		 614 aa  62  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  27.42 
 
 		 574 aa  62  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0226  hypothetical protein  25.81 
 
 		 356 aa  61.6  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.171941  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1748  PHP-like  28.29 
 
 		 650 aa  61.6  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00399585  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  27.06 
 
 		 557 aa  60.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0395  hypothetical protein  25.62 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  26.37 
 
 		 586 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1786  phosphotransferase domain-containing protein  23.74 
 
 		 543 aa  60.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  25 
 
 		 578 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0230  PHP-like protein  26.19 
 
 		 569 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13892  hypothetical protein  24.12 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5687  hypothetical protein  25.13 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196791 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  25.76 
 
 		 570 aa  59.7  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1154  phosphotransferase domain-containing protein  25.85 
 
 		 578 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000251601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  26.01 
 
 		 592 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1723  PHP domain protein  28.86 
 
 		 560 aa  59.3  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00699818  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1901  PHP domain protein  28.5 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  24.51 
 
 		 588 aa  58.9  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4795  PHP domain protein  24.22 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  30.08 
 
 		 598 aa  58.5  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1597  hypothetical protein  26.71 
 
 		 566 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  25.15 
 
 		 580 aa  58.2  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  27.67 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1131  PHP domain protein  26.74 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1948  PHP domain protein  23.79 
 
 		 576 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.453444  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  27.67 
 
 		 650 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0618  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.16 
 
 		 740 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138492  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1609  PHP-like protein  26.32 
 
 		 572 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.379827 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  25.75 
 
 		 569 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0081  family X DNA polymerase IV  24.56 
 
 		 563 aa  55.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.439053  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5653  PHP domain protein  25.71 
 
 		 572 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  25.12 
 
 		 577 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2830  PHP domain protein  26.01 
 
 		 577 aa  55.1  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  27.54 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000135059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4865  hypothetical protein  24.63 
 
 		 332 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2341  PHP domain-containing protein  24.64 
 
 		 536 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  23.04 
 
 		 594 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  25.6 
 
 		 578 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4410  PHP domain protein  29.85 
 
 		 582 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.969464 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4543  PHP domain protein  29.85 
 
 		 582 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00710379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0614  hypothetical protein  24.27 
 
 		 344 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00333574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  25.25 
 
 		 560 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06190  hypothetical protein  25.99 
 
 		 360 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1075  PHP domain protein  24.4 
 
 		 584 aa  50.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1323  PHP domain protein  23.36 
 
 		 582 aa  50.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0829  PHP-like  26.74 
 
 		 580 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1766  phosphotransferase domain-containing protein  23.9 
 
 		 576 aa  50.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  22.07 
 
 		 583 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3374  PHP domain protein  26.24 
 
 		 349 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4386  phosphotransferase domain-containing protein  25 
 
 		 588 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4395  hypothetical protein  25.71 
 
 		 337 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  27.5 
 
 		 579 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2447  PHP domain protein  25.73 
 
 		 580 aa  48.1  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0459  phosphotransferase domain-containing protein  30.18 
 
 		 586 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2703  PHP domain protein  24.85 
 
 		 576 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00677466  hitchhiker  0.00000000129938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3104  DNA polymerase X family protein  24.85 
 
 		 576 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.533704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  24.14 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  24.02 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000619827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>