37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3788 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3788  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2394  hypothetical protein  57.98 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0178695  decreased coverage  0.00206259 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5200  hypothetical protein  59.75 
 
 		 316 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0575835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4036  hypothetical protein  48.23 
 
 		 312 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0418  hypothetical protein  41.87 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1696  hypothetical protein  37.85 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0637378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5355  hypothetical protein  42 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00203368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5885  hypothetical protein  41.03 
 
 		 309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2666  hypothetical protein  39.94 
 
 		 318 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7195  hypothetical protein  40.59 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.7944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2322  hypothetical protein  37.35 
 
 		 344 aa  196  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.101209  normal  0.675092 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0539  hypothetical protein  39.26 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.192006  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4585  hypothetical protein  38.66 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.552031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1375  hypothetical protein  40.51 
 
 		 298 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4078  hypothetical protein  38.46 
 
 		 332 aa  189  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.658142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1198  hypothetical protein  40.21 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.477768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2411  hypothetical protein  37.98 
 
 		 297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3040  hypothetical protein  39.19 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2258  hypothetical protein  38.91 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3517  hypothetical protein  38.18 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1212  hypothetical protein  38.6 
 
 		 325 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0331476  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1461  hypothetical protein  39.36 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.438703  hitchhiker  0.00249113 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1474  hypothetical protein  38.75 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.825893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2128  hypothetical protein  35.82 
 
 		 321 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25006  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0886  hypothetical protein  38.79 
 
 		 308 aa  159  8e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0404  hypothetical protein  39.27 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2113  hypothetical protein  32.86 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1537  hypothetical protein  36.07 
 
 		 313 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270816  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0663  putative periplasmic protein  34.78 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.592968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2594  hypothetical protein  33.74 
 
 		 313 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345899  hitchhiker  0.00464449 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0176  probable secreted protein  35.16 
 
 		 263 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0170  hypothetical protein  35.16 
 
 		 263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0171  hypothetical protein  35.16 
 
 		 263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0179  probable secreted protein  35.16 
 
 		 263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0170  hypothetical protein  34.8 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3624  hypothetical protein  32.49 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.653397  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3947  hypothetical protein  31.92 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.519499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>